pca百分比取多少比较好

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pca百分比取多少比较好

2023-07-15 02:15| 来源: 网络整理| 查看: 265

输入:

1、FPKM矩阵(FPKM Matrix)。

示例:

T4    T5    T6    T7    T8    T9

BM590_A0001         390.11      379.54      386.52      288.73      372.47      327.73

BM590_A0002         350.06      310.51      328.78      175.32      249.21      210.62

BM590_A0003         222.52      219.54      209.39      174.45      97.20        240.38

BM590_A0004         406.46      494.13      414.62      825.09      2678.41    555.67

BM590_A0005         605.70      755.09      643.55      1184.73    2980.14    568.58

BM590_A0006         306.72      311.16      351.08      282.26      204.19      310.56

……

2、样品分组信息表(可选)。

示例:

T4     group1

T5     group1

T6     group1

T7     group2

T8     group2

T9     group2

输出:

1、pca.sites.txt:记录了样品在各个维度上的位置,用于作图的数据。对PC1和PC2作散



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