OR值的意义和计算公式,和95% CI |
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OR值的意义和计算公式,和95% CI
ML_NI_CSU 2014-11-11 21:49:47 34780 收藏 2 展开 OR值的全称是oddratio,又称比值比,对于发病率很低的疾病来说,它是OR值即是相对危险度的精确估计值。 计算公式如下: Odd ratio, 95%CI 假定我们要鉴别一个基因(或者标记位点SNP)有两个等位基因(等位):记为 Allele 1 Allele 2
Allele1 Allele2 病例 A B 对照 C D
odds 值在病例和对照可以计算如下: 病例Allele1Odds =A (A + B)/ B (A +B)=A/B 对照Allele1Odds =C (C + D)/ D (C+ D)=C/D
那么在这一点Allele1的OR值可以计算如下: Odds Ratio =(A / B)/(C /D)=AD/BC 同样的,95% Confidence Intervals (CIs)值可以计算如下: 95% CI of ln(OR) = ln(OR)±1.96(1/A+1/B+1/C+1/D)0.5 95% CI of OR = e95% CI ofln(OR)、
logistic回归中,OR值=1,表示该因素对疾病的发生不起作用 OR值大于1,表示该因素是一个危险因素 OR值小于1,表示该因素是一个保护因素 同时最好要算出它的95%CI OR为比值比,也称优势比 当我们已知疾病的发生状况,比较疾病组与非疾病组危险因素暴露的情况差异时(即回顾性研究时),用OR进行定量描述。OR是否有意义还要看其P值,一般95%CI上限小于1时说明可能是保护因素,相反如果下限大于1则说明可能是危险因素。
ln(OR)近似服从正态分布,因此在计算OR值置信区间的时候都是先计算ln(OR)置信区间,再计算OR置信区间(参考:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1127651/,http://bioterrorism.slu.edu/bt/products/bio_epi/scripts/mod12.pdf,http://www.sjsu.edu/faculty/gerstman/StatPrimer/case-control.pdf)
参考资料1(维基):http://en.wikipedia.org/wiki/Odds_ratio# 定义:Definition interms of group-wise odds Ifthe probabilities of the event in each of the groups arep1 (first group) andp2 (secondgroup), then the odds ratio is: whereqx = 1 − px.An odds ratio of 1 indicates that the condition or event understudy is equally likely to occur in both groups. 参考资料2:http://www.bioinformatics.org/snp-tools-excel/ 例子1: 例子2: 参考资料3:blackwell出版社 http://www.blackwellpublishing.com/specialarticles/jcn_10_268.pdf 参考资料4:http://intmedweb.wfubmc.edu/ebmreviews/odds.html 参考资料5:http://hydra.usc.edu/scehsc/pdfs/D-1-3-3lesson calculating odds.pdf 参考资料6 :http://stanford.edu/class/gene210/files/writeups/gwas-howto-2.pdf 参考资料7: http://www.statsdirect.com/help/exact_tests_on_counts/gart.htm(介绍了OR和RR区别和联系)
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