Origin绘图

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Origin绘图

2022-05-07 13:17| 来源: 网络整理| 查看: 265

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|本文作者:莫北

桑基图(Sankey plots)用来展示数据的“流动”变化,分支的宽度表示流量的大小,应用于能源流向、收入支出、人员流动等数据的可视化。在一些高分文章中我们有时会看到她的身影,比如下图这篇人肠道微生物组的Science文章用桑基图展示菌群的季节性动态演化过程。

(Science,2017)

那么怎么绘制这样的图表呢?这篇Science用D3.js (http://d3js.org)绘制,你也可用d3Network、Networkd3等R包绘制,但对于初学者感觉难度都很大。今天为大家介绍Origin 2019绘制类似这样的桑基图。

数据准备

在之前的文章中有提到按“F11”键就可以快速进入origin的“Origin central”直接套用模板去学习作图,如下图,在新版的Origin 2019已将“Origin centra1”改为“Learning center”。 今天我们就直接用它的实例数据作图。

双击实例中的图表即可打开实例图表的工程文件,我这里只需数据,所以复制了一份到文件夹Folder1中,数据为历史上著名的泰坦尼克号事故中旅客和船员的是否获救记录(如下图)。数据只要是原始的分类记录即可,不需要手动计数。

双坐标轴图

为了便于理解,我这里先画两个坐标轴的桑基图,看一下成人和小孩的幸存情况。类似Excel的操作,将鼠标指针悬停在表格列名上然后选中3、4列数据(包括分组数据),如下。

然后进入Plot菜单,找到Parallel Sets。

点击一下Parallel Sets即可完成绘制,初始结果如下:

可见孩子的存活比例比成人高,虽然女人和孩子可优先乘坐救生船,但仍有约一半的小孩没能获救。

三坐标轴

接下来增加点复杂度,同样的方法选择数据,这次加入性别数据,如下图。

绘制的初始结果如下:

类似于常规图表,双击坐标轴可以对坐标轴的粗细、颜色、刻度朝向等进行调整,如下。

双击图表区域,在Plot Details窗口也可改变颜色,可选择已有的配色方案,比如这里选Q05。

类似《如何用Origin绘制分边小提琴图》一文,如果对Q05的颜色不满意,还可点右侧的“✏”,自定义颜色列表,如下图。

调整配色后的结果如下:

勾选Combined Sets可将相同“流向”的数据进行合并,如下图。

具体的合并方式和结果见下图:

四坐标轴

同样的方法将4列数据全选,绘制结果如下图:

Transparency调整颜色的透明度,Curvature(曲率) 调整颜色“条带”的转角。

如果将Curvature(曲率)值调为0 %,就得到下图的效果。“直的”也不错,嗯,我还是觉得“弯的”比较好看。

曲率这里改回默认的30 %,换一下配色,最终可得到多种效果,如下:

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今天的内容就到这里啦~

参考文献Samuel A. Smits,Jeff Leach, Erica D. Sonnenburg, et al. Seasonal cycling in the gut microbiome of the Hadzahunter-gatherers of Tanzania. Science 25 Aug 2017:http://science.sciencemag.org/content/357/6353/802

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