NSR在2014年创刊时采用免费出版模式，所有文章上线后以Free Access形式免费下载，不向作者收取费用，作者可以选择支付OA费用、以OA形式出版论文（Optional OA）。当时NSR没有采用传统订阅模式，也没有采用完全开放获取模式，而是选择了以Free Access形式尽可能扩大刊物的国际传播和影响力。直到2019年底，综合考虑NSR发展情况和国际出版最新趋势，合作双方决定将NSR转变为完全开放获取模式，向作者收取APC并设置了灵活的免除政策。因此NSR在2020年以前没有足够的来自于订阅或者OA的收入，科学出版社与OUP也没有采用传统的打包付费或者利润分成等财务模式，而是根据刊物实际情况，科学出版社每年向OUP支付NSR产生的实际出版成本，并另外支付一定费用作为OUP的利润。这种合作模式的优势在于成本可控，OUP的出版成本很大程度取决于NSR的论文出版量，关于NSR出版的大额支出都需要主办方同意，对于一些比较昂贵的市场推广项目等，编辑部可以要求OUP适当控制成本以节约开支。此外，NSR主办方在预算充足的年份，也可以要求OUP增加预算做一些特定的推广，双方在多年出版中也积累了很多关于期刊财务合作的经验。