MS中Perl脚本实现原子随机掺杂(或生成空位) |
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MS中Perl脚本实现原子随机掺杂(或生成空位)
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MS中Perl脚本实现原子随机掺杂或生成空位
1、初始模型2、确定原子掺杂比例3、建立perl脚本文件4、Perl脚本内容5、运行脚本，查看结果7、生成空位
以Au与Pt按一定比例随机掺杂建立混合模型为例，注意思路是Au中原子被Pt取代，初始模型皆是从MS模型库中导入的，脚本使用时仅需做少量更改即可。 1、初始模型
单击Au中某一个原子，之后在Properties (1) 中点击IsMixtureAtom (2) ，点击Add (3) 添加第二种原子类型，选择为Pt (4) ，并更改掺杂的比例为12.5% (5) ,最后更改Au比例为87.5% (6) 。
代码附上，使用只用改参数（Au.xsd以及($disorderedStructure,2,2,1)）即可，注意两点：（1）这里建立超胞越大，原子数越多，可能的掺杂情况也就越多，计算就越慢。（2）根据掺杂比例建立超胞，比如本示例掺杂比例为7:1，因此Au超胞至少有8个原子，导入的原胞只有4个原子，因此至少（2,1,1）的超胞才能完成此次原子替换。 #!perl use strict; use Getopt::Long; use MaterialsScript qw(:all); my $disorderedStructure = $Documents{"Au.xsd"}; my $results = Tools->Disorder->statisticalDisorder->GenerateSupercells ($disorderedStructure,2,2,1); #build supercell my $table = $results->StudyTable; print "Number of disorder configurations generatured:".$results->NumTrreducibleConfigurations."\n"; 5、运行脚本，查看结果结果如下，脚本下方提示运行完成生产了5中体系，表示Pt掺杂位置不同的五种结构，可以再std文件中查看。 生成空位也利用上述脚本，不同之处在于修改的是Occurpancy来定义空位比，而不是替换的IsMixtureAtom，其余操作相同。 |
STD文件中第二列为该结构类型的等效结构有多少种，第三列为该结构原子排列情况。 
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