MySQL协议是一种用于MySQL数据库通信的网络协议，通过该协议客户端可以与MySQL服务器进行通信，发送SQL语句，获取查询结果等操作。

MySQL协议是基于TCP/IP协议的，客户端和服务器之间的通信是通过TCP连接来进行的。在建立连接之后，客户端会向服务器发送握手请求，服务器会返回握手响应，完成连接的建立。之后客户端可以向服务器发送SQL语句请求，服务器会解析SQL语句并返回相应的结果。在整个通信过程中，MySQL协议的格式和规范对于通信的正确进行起到了关键作用。

MySQL协议的底层原理是通过二进制协议来进行数据传输，通过一系列的数据包来进行客户端和服务器之间的通信。MySQL协议的数据包主要包括：

握手数据包（Handshake Packet）：客户端和服务器建立连接时，服务器会向客户端发送握手数据包，包含了服务器的版本号、认证信息等。

认证数据包（Authentication Packet）：客户端收到服务器的握手数据包后，会发送认证数据包给服务器，用于完成连接的认证。

查询数据包（Query Packet）：客户端发送SQL语句请求时，会发送查询数据包给服务器，包含了SQL语句和查询选项等。

结果数据包（Result Packet）：服务器收到查询数据包后，会解析SQL语句并返回结果数据包给客户端，包含了查询结果和结果集信息等。

MySQL协议的底层原理是通过这些数据包来完成客户端和服务器之间的通信，从而实现了MySQL数据库的功能。