如何快速地分析基因结构和基因家族? |
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准备拟南芥所有MYB的ID 列表,也可以不准备,不过就需要自己先筛选并且只保留MYB相关的拟南芥的记录,点击跳转,拟南芥有168个MYB,如果要用GSDS_v2在线输出结果,那么可能会达到文件上限,于是就做不了,这个时候,你需要做网页工具本地化,还是可行的;不过TBtools更方便,只要给够内存,无限个都可以做。 出图并直接调整图片大小。 在TBtools中直接进行图片调整,改变高度或者取色器直接修改颜色。 当然,支持自定义Feature是必须的。 支持输入mRNA/pre-mRNA对应的坐标,这样就直接展示序列上,无论指定的区域是否是CDS 还是 UTR 还是 Intron。 支持输入Protein对应的坐标,比如pfam结果,NCBI cd-search结果,或者其他基于蛋白序列分析,得到的一个区域,TBtools内部会进行自动转换,并映射到CDS上。 附上一个课题组秒出的图,中间和右边部分,发工具过去,等几秒,收到QQ消息…… 秒出 !!! 还有隐藏功能!!!点击某处,弹出序列,惊不惊喜,意不意外? 最新版的TBtools下载地址: http://www.omicshare.com/forum/thread-1062-1-7.html返回搜狐,查看更多 |
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