R语言使用boot包进行ROC重抽样获取可信区间并绘图

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R语言使用boot包进行ROC重抽样获取可信区间并绘图

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本人关于重抽样的文章也陆陆续续写了6-7篇,各种类型的都写了一点,本篇文章不在计划内,本来不打算写了。 在这里插入图片描述 但是有些粉丝私信我,觉得使用sample函数重抽样不怎么正规,感觉不是真正的重抽样,要使用boot包才正规,看起来有面子。其实sample函数是R里面最基本的抽样函数,我们很多重要的R包如rms包、proc包都是使用它来重抽样的,sample函数抽样非常简单,而且灵活,等会进行演示。还有些朋友把文章《Boot重抽样获取logistic回归内部验证AUC可信区间》和文章《Boot重抽样获取logistic回归模内部验证AUC并绘制带可信区间的重抽样ROC曲线》搞混了,这两个文章其实抽样还是有点不同的,不能把第一个的方法直接放进第二个里面去,要使用第二个的方法进行取值并绘图(2个同时进行)。 下面我们直接开始,我准备结合上两篇介绍2种方法使用sample函数和boot包分别进行重抽样并绘制roc曲线,并进行比较,算是对本内容的一个总结把。 先说结论,下图是sample函数和boot包分别绘制的重抽样曲线图,boot置信区间稍微宽一点,其他都差不多。 在这里插入图片描述 下面我们就正式进入主题,先做sample函数的,先导入数据和R包

library(pROC) library(tidyverse) library(boot) bc


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