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宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一，为加强宏基因组学技术和成果交流传播，推动全球华人微生物组领域发展，中科院青年科研人员创立“宏基因组”公众号，联合海内外同行共同打造本领域纯干货技术及思想交流平台。

公众号每日推送，工作日分享宏基因组领域最新成果、科研思路、实验和分析技术，理论过硬实战强；周末科普和生活专栏，轻松读文看片涨姿势。目前分享3100+篇原创文章，15万+小伙伴在这里一起交流学习，累计阅读超3500万+。

公众号合作创办了宏基因组学、微生物组和生物信息高起点新刊“iMeta” ，由威立、肠菌分会和本领域数百位华人科学家合作出版的开放获取期刊，主编由中科院微生物所刘双江研究员和荷兰格罗宁根大学傅静远教授共同担任。目标是发表前10%(IF > 15)的高影响力论文。详见： iMeta创刊宣传片。发布了本领域首本专著《微生物组实验手册》，由本领域352位同行参与编写，免费开源且持续更新，详见125家单位联合完成《微生物组实验手册(Microbiome Protocol eBook)第1版》。

创办了世界首本微生物组与生物信息学交叉高起点新刊iMeta。

注：所有蓝字均为文章链接，点击阅读原文

iMeta创刊宣传片全球首发-中文版(双语字幕)

总结2022，迎接2023！iMeta 2022年度最佳综述评选

iMeta | 2022年发文60篇被引340次完美收官，因为有你2023将更精彩

2023中国肠道大会 ｜ iMeta专刊征稿进行中！

iMeta | 黄源/邓越/苏展豪/辛凤姣-心血管疾病与肠道微生物组专刊征稿

iMeta期刊26位编委入选2022年全球高被引学者

iMeta科学编辑招聘启事(可居家办公，弹性工作)

iMeta被DOAJ数据库收录！(2022/10/17)

iMeta在中国知网（CNKI）中如何被快速检索

iMeta | 被引用500次，发文85篇，立即指数5.88，百引耗时38天(2023/2/26)

iMeta | 被引用400次，发文71篇，立即指数5.63，百引耗时36天(2023/1/19)

iMeta | 引用300次，发文60篇，立即指数5，百引耗时49天(2022/12/14)

iMeta | 引用200+，立即指数3.98，百引耗时54天(2022/10/26)

iMeta期刊3篇文章被PubMed收录

iMeta创刊花絮-探索未知，永不止步(全球青年编委的祝福)

iMeta高起点期刊创刊会暨学术研讨会成功举办：宣传片、现场视频、报告直播回放

iMeta期刊青年编委招募(定位IF>15)

iMeta | 姚彦坡/鞠峰/崔丽/牛犇主持土壤环境生物安全与健康专刊征稿

iMeta | 娄翼来/Mendes/Kudrin主持金砖国家土壤微食物网专刊征稿

2022年9月最新学术出版透明与最佳行为准则

iMeta | 百度认证完成，搜索“iMeta”直达出版社主页和投稿链接

iMeta | 国际标准刊号ISSN印刷版正式确认，双ISSN申请完成

iMeta 恭祝您新春快乐！

iMeta | 2023年1月发展报告

西农焦硕/韦革宏等-干旱生态系统中土壤真菌与细菌群落构建的关系

网络分析平台iNAP图文/视频教程

生物信息/微生物组期刊推荐： mBio

生物信息/微生物组期刊推荐：mSystems

生物信息/微生物组期刊推荐： ISME Journal

生物信息/微生物组期刊推荐：Microbiome

生物信息/微生物组期刊推荐：Nature Biotechnology

期刊预警：Microbiology Spectrum 是9分刊吗？今年可能只有3分

惊人！iMeta发表文章被166个国家和地区下载104215人次！单篇最高10000+人次！

iMeta | 引用过百次，立即指数 > ISME、NAR等期刊2倍 (2022/9/2)

iMeta | 英文新媒体推特(twitter)主页关注人数破千(22/10/1)

iMeta公众号关注人数破万

iMeta | FSCapture报告录屏和视频剪辑(视频教程)

iMeta | EndNote调整完美引文格式教程

Publons：文章审稿、编辑工作认证平台

如何投稿iMeta期刊？ScholarOne投审稿系统作者使用教程

报告视频录制：腾讯会议录屏+人像画中画特效

高影响力期刊iMeta扬帆起航(微生物组&生物信息)

iMeta被Scopus数据库收录！

iMeta入驻ResearchGate学术社交平台助力期刊国际化发展

iMeta：已被谷歌学术(Google Scholar)收录

iMeta期刊投审稿系统ScholarOne正式上线

iMeta期刊12名编委入选科睿唯安2021年度高被引学者

iMeta宏基因组&生物信息期刊-创刊背景和简介

iMeta期刊顾问James M Tiedje当选中国科学院外籍院士

中国大陆SCIE收录期刊分析：多少本刊？发文多少？解决了多大内卷？未来在哪里

微生物领域SCIE期刊分析(英美各40本，中国大陆0本)

如何破解中国95%SCI论文外流的困局

Wiley开放科学大使访谈——刘永鑫

iMeta 2022年度最佳方法评选

iMeta 2022年度最佳研究评选

iMeta 2022年度最佳综述评选

iMeta 2022年度最佳图文摘要评选

iMeta 2022年度“最佳综述”评选结果

iMeta 2022年度“最佳研究”评选结果

iMeta 2022年度“最佳方法”评选结果

iMeta |吴小立/谢黎炜综述肠道菌群可能作为精神分裂症和肥胖症发病机制的共同枢纽

iMeta | 中科院城市所杨军团队揭示城市公园微生物迁移对生物多样性和生态功能的影响

iMeta | 中国农业大学汪杰组“塑料际”微生物最新综述

iMeta | 格罗宁根大学傅静远组发表对于Nature微生物菌株传播研究的评论

iMeta | 南方医科大学谢黎炜、马颖联合发现新生儿肠道微生物网络结构变化规律

iMeta | 浙大吴顶峰和同济刘蕾等对微生物富集分析中Reporter Score的误用研究

iMeta | 印遇龙院士/郑大魏勇军等综述益生菌发酵中草药的研究进展

iMeta | 调控肠道菌群的宿主源代谢分子概述

iMeta | 西湖大学郑钜圣团队：妊娠期糖尿病队列研究方案

iMeta期刊 第2卷第1期 在线正式发布

iMeta期刊 第2卷第1期 封面正式发布

iMeta | 兰州大学张东青年研究员：使用PhyloSuite进行分子系统发育及系统发育树的统计分析

iMeta | 宁波大学附属第一医院崔翰斌团队综述缺血性心脏病相关肠道微生物及菌群代谢物研究进展

iMeta | 2022年iMeta进展与审稿人致谢

iMeta | 中科院植物所周世良团队和河北工程大学刘艳磊团队揭示现代丝绸之路东段植物物种多样性格局及其影响因素

iMeta | 易扩增子(EasyAmplicon)：易用、可重复的微生物组扩增子分析流程

iMeta | 李香真/姚敏杰开发微生物共现网络比较流程

iMeta | OmicStudio：一款可组合的、即时反馈的可生成高质量的发表级图表的生物信息云平台

iMeta | 农科院资划所曹卫东组揭示种植利用豆科绿肥内源驱动土壤自生固氮的作用

iMeta | 北中药李晓骄阳组综述解码免疫T细胞的作用-改善代谢相关脂肪性肝病的新领域

iMeta | 中科院武汉植物园杨玉义组探究浮游生物应对城市湖泊藻华加剧的分化策略

iMeta | 兰州大学刘勇勤组揭示植物定殖对冰川前缘微生物群落动态的影响

iMeta | 南京农业大学韦中组开发多病原生物污染高通量快检平台

iMeta | 南科大夏雨组综述二三代宏基因组分析的策略和工具(Illumina & Nanopore)

iMeta | 俄亥俄州立大学郑庆飞组发表多组学方法研究肿瘤微生物组综述

iMeta | 山东大学刘建团队–盐度胁迫削弱了微生物世界的马太效应

iMeta｜哈佛医学院刘洋彧组揭示生态动力学对微生物溯源的挑战

iMeta｜暨南大学陈嘉莉/白卫滨综述高脂饮食介导的肠菌紊乱与慢性疾病的互作机制

iMeta | 西悉尼大学刘洪伟/张海洋-温暖和干燥环境选择基因组较小的细菌

iMeta｜南医大刘星吟组研发微生物绝对丰度变化新方法(QMD)

iMeta | 大连海洋大学傅松哲和根特大学杨倩开发宏基因组测序和流式细胞术相结合的工作流程

iMeta | 中科院地球环境研究所王云强组解析了草地土壤微生物生活史策略

iMeta | 湘雅医院刘庆组-泛癌分析揭示铜死亡调节子的临床和分子特征

iMeta | 第1卷第4期来自8个国家的20篇文章正式发布(2022.12)

iMeta | 原核微生物泛基因组与基因组分析平台IPGA

iMeta | 中科院南京土壤所吴永红组揭示周丛生物非生物成分的地理印记和生态功能

iMeta | mibPOPdb: 华中科技大学张后今开发微生物降解数据库

iMeta｜中科院微生物所刘双江组发布人源毛螺菌科菌株资源库和菌株水平代谢谱

iMeta | 水科院南海所姜敬哲/中大施莽利用病毒组揭示的牡蛎体内的新型RNA病毒

iMeta | 中国农大杨栋组揭示膳食纤维化学结构对肠道微生物的调控

iMeta | 同济大学朱瑞新团队靶向基石菌种可恢复非酒精性脂肪肝中失调的产丁酸菌

iMeta | 中科院上海巴斯德所崔杰组综述海洋RNA病毒圈的二十年研究

iMeta | 扬州大学杜予州团队揭示同域内同食物的两种昆虫肠道微生物群落装配机制

iMeta | 南医大余光创组ggtree最新文章-系统发育树存储与可视化的数据结构

iMeta | 中科院南土所褚海燕组揭示真菌对高寒林线多界生物群落的稳定作用

iMeta | 中农马曦组综述肠道菌群与干细胞巢互作维持肠内稳态平衡

iMeta | 德加合作揭示葛藤菌根真菌的遗传多样性和群落组成

iMeta | 华科宁康等打通中药成分鉴定和网络药理分析，助力中药标准化数字化国际化

iMeta | 浙大蒋超组综述环境暴露组全景景观图

iMeta | 成都中医药大学张杨组开发抗新冠中医药及其机制与疗效数据库

iMeta | 青岛华大范广益组基于共标签测序数据的高质量宏基因组组装工具MetaTrass

iMeta | 厦门大学马永慧组探究捐菌者对肠菌移植的伦理认知和态度

iMeta | 第1卷第3期来自8个国家的14篇文章正式发布(2022.9)

iMeta | 南农沈其荣团队发布微生物网络分析和可视化R包ggClusterNet  教程 计算网络稳定性

iMeta | 德国国家肿瘤中心顾祖光发表复杂热图(ComplexHeatmap)可视化方法 这是世界上最短的引文？

iMeta | 海南大学张家超组-基于肠道菌群SNV基因标记物的炎症性肠病预测模型

iMeta | 深圳先进院戴磊组开发可同时提取共存菌株的组成和基因成分谱的菌株分析工具 视频教程

iMeta | Sangerbox: 交互式整合临床生信分析平台

iMeta | 短读长扩增子测序是否适用于微生物组功能的预测？

iMeta | 林雁冰/James M. Tiedje/谷洁等揭示菌群对寄生植物列当的调控作用

iMeta | 东农吴凤芝/南农韦中等揭示生物炭抑制作物土传病害机理

iMeta | 华南农大陈程杰/夏瑞等发布TBtools构造Circos图的简单方法

iMeta | 叶茂/时玉等综述环境微生物组中胞内与胞外基因的动态穿梭与生态功能

iMeta | 华南师大王璋组综述人体肺部微生物组与人类健康和疾病之间的隐秘关联

iMeta | 中农李季组揭示有机农业长期定位试验番茄微生物组结构

iMeta | 新加坡城市污水处理厂中流式细胞仪分类群落和鸟枪法病毒宏基因组学的比较研究

iMeta | 第1卷第2期 在线正式发布(2022.6)

iMeta | 中科院生态中心邓晔组发布微生物组网络分析平台iNAP

iMeta | 南京医科大学孔祥清团队创建前瞻性多组学纵向原发高血压队列eHypertension

iMeta | Majorbio Cloud：一站式多组学数据分析平台

iMeta | 南医大陈连民/孔祥清等综述从基因组功能角度揭示肠菌对复杂疾病的潜在影响

iMeta | 北大陈峰组综述口腔微生物组的标准化研究：从技术驱动到假说驱动

iMeta封面 | 宏蛋白质组学分析一站式工具集iMetaLab Suite(加拿大渥太华大学Figeys组) 1小时视频教程+PPT

iMeta | 北大陈峰/陈智滨等发表口腔微生物组研究中各部位取样的实验方法(Protocol)

iMeta | 南昌大学丁霞等-水产养殖系统对中华鳖微生物组和肠道代谢组的影响

iMeta｜西工大钟杨权威等-根系菌群沿环境梯度的响应机制

iMeta | 深圳先进院马迎飞组开发基于神经网络分析肠道菌群的方法

iMeta | 华南农大曾振灵/熊文广等-家庭中宠物犬与主人耐药基因的共存研究

iMeta | 南科大夏雨组纳米孔测序揭示微生物可减轻高海拔冻土温室气体排放

iMeta | 第1卷第1期在线正式发布(2022/3/28)

iMeta | 高颜值高被引绘图网站imageGP

iMeta: 整合宏组学重新认识生命和环境科学

iMeta | 吴青龙/王明福/刘金鑫等-从肠道菌群看待人类对高原饮食的适应性

iMeta | 德布鲁因图在微生物组研究中的应用

iMeta | 南科大宋毅组综述逆境胁迫下植物向微生物组求救的遗传基础

iMeta | 华中科大宁康组综述用于蛋白质结构预测的宏基因组定量分析

iMeta | 电子科大林昊组开发蛋白质赖氨酸乳酸化位点预测工具DeepKla

iMeta | 青岛大学苏晓泉组开发跨平台可交互的微生物组分析平台

iMeta | 西农韦革宏团队焦硕等-土壤真菌驱动细菌群落的构建

iMeta | 哈佛刘洋彧等基于物种组合预测菌群结构的深度学习方法

iMeta | 中科院李小方等膳食甘草促进小鼠镉解毒并调节肠道菌群代谢

iMeta | 浙大倪艳组MetOrigin实现代谢物溯源和肠道微生物组与代谢组整合分析 视频教程

山峦图展示微生物丰度随盐度增加的动态变化

如何用python画世界地图，并用不同的颜色展现每个国家的数据？

ggplot2绘制相关性分析线面组合热图

双侧柱状图展示具有正负相关性的类型数量

跟着iMeta学做图｜用三元图展示微生物种群相对丰度

分面箱线图展示alpha多样性并用标注差异分析结果

ggplot2包绘制棒棒糖图展示变量间的相关性

绘制基于非加权Unifrac距离的主坐标分析PCoA图

ComplexHeatmap包绘制热图展示不同样本物种相对丰度

用ggClusterNet绘制共现网络（Co-occurrence Network）

circlize绘制环状热图展示细菌功能聚类分析

NMDS分析展示群落beta多样性

群落微生物与环境因子相关性分析

circlize绘制和弦图展示样本物种相对丰度

ggplot2绘制多个饼图展示菌群物种组成

微生物组共现网络（Co-occurrence Network）绘制

ggplot2绘制曼哈顿图展现物种丰度差异

跟着iMeta学做图｜ComplexHeatmap绘制多样的热图

世界海拔地图

使用ImageGP绘图热图Heatmap

使用ImageGP绘图富集分析泡泡图

使用PMS分析微生物组(图文+视频)

DeepKla预测赖氨酸乳酸化位点

分享高颜值免费在线绘图介绍和使用的一次视频直播

视频演示 | 如何解读和在线绘制进化树并添加属性注释？

视频演示 | WGCNA加权共表达分析在线操作

视频演示 | ImageGP重新绘制WGCNA性状关联热图

视频演示 | 在线差异基因/物种分析

视频演示 | 画个火山图，标记下基因的名字

视频演示 | BIC无代码绘制差异基因火山图

视频演示 |点点鼠标在线绘制GO/KEGG富集分析泡泡图

视频演示 | Meta-gene图谱在线绘制

视频演示 | 高颜值免费在线绘图工具功能预览和帮助预览

视频演示 | 在线轻松绘制配对连线箱线图

简单强大的在线绘图

简单强大的在线绘图-升级版

简单强大的在线绘图-第3版

在线WGCNA分析 （直接出交互式结果报告）

在线差异基因分析 （支持自动和指定批次校正）

这个工具可以组合参数画出2种单细胞Marker显示图

高颜值免费在线SCI绘图工具增加上传功能

ImageGP新上几个小工具

如何保证文章中同一组样品在不同子图颜色一致？

推荐一款生信分析工具的集大成者

视频演示 | 功能新增 | 增强版在线LEFSe分析和可视化鉴定标志性基因或物种

Venn网络展示富集分析结果

单个基因集富集分析泡泡图绘制

多个基因集富集结果泡泡图绘制展示

无代码调整聚类热图分支顺序

基因表达热图聚类并增加行列注释

热图绘制一个快乐五一

轻轻松松画个热图

续昨天的文章，在火山图标记基因名字

画个火山图，标记下基因的名字

无代码绘制基因表达箱线图

什么是倾斜45度的火山图？

在线直接绘制倾斜45度的“火山图”

在线进行 PCoA 分析和相关统计检验

125家单位联合完成《微生物组实验手册(Microbiome Protocol eBook)第1版》

Nature综述：培养未被培养微生物的创新方法

北京人都是什么文案鬼才，被他们的抗阳段子笑死了

第一：做学位论文期间，不要有任何度假休息的打算；第二，导师错的时候不多；第三……

施一公：博士没有和导师几百小时的交流和训练，是出不来的！培养学生要靠“耳濡目染”

刘永鑫：想学菌群生物信息分析-21分钟带你入门

遗传：微生物组数据分析方法与应用

Nature：微生物培养技术发展迅猛，未来要搞定一切！

USEARCH—最简单易学的扩增子分析流程(中国总代理)

Nature综述：Rob Knight手把手教你分析菌群数据2020更新版

微生物组入门必读+宏基因组实操课程

宏基因组分析教程

学术论文图表基本规范大全

一篇所有研究生都该读的好文：阳光温热 科研静好

这就是我的研究生生活

人体上的生命：看完此片我想把身上的细菌寄生虫供起来

Science：科学家亲眼看到细菌产生耐药性的全过程

Nature综述：微生物构成的氮循环网络

Nature替宠物正名：宝宝身体好，猫狗不可少

DNA提取也能发Nature？

再这么配培养基，你的细菌都被毒死了！

这种本该消失的恐怖传染病卷土重来是一场人祸

一席-赵立平-大树细菌

给多头绒泡菌叫外卖，它真的很喜欢吃平菇

一顿寄生虫大餐，或能治好干净引来的免疫病

NBT封面：水稻NRT1.1B基因调控根系微生物组参与氮利用

一片看懂肠道菌群在人体中的作用

岛国科普—生命大跃进

3分和30分文章差距在哪里？

28个实用绘图包，总有几个适合你

测序发展史，150年的风雨历程

Nature评论：中国成为超级大国，背后是科学的力量

美国科学院公布未来农业发展方向-生物信息和微生物组

下一次农业革命，微生物或为突破口

从高考状元，到中科院最年轻博导！她拿下这一国际大奖，中国首个！

许多博士生的一个通病：对导师过度依赖！

从复旦博士生到985高校副教授，贫穷使人深知摆脱自卑的艰难

速收藏 ！回复审稿人意见时常用的英文套话

朱永官、张福锁 等：土壤微生物组与土壤健康

朱永官：中国土壤微生物组进展与展望

2019国自然微生物中标4个亿

下次诺奖会是他吗？肠道微生物组开创者Jeffrey Gordon

细菌的八大超能力

导师太牛而自己很水，是一种怎样的体验？

你想要的生信知识全在这—生信宝典

NBT：实验vs分析，谁对结果影响大

NC：16S序列预测培养基配方

Cell：人与肠道菌群休戚与共的一生

35张图，看懂肠道和大脑的魔性关系

深度好文—我们的未来在哪里？

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手把手带你重现菌群封面文章图表

79个超强微生物知识助你孕育超优宝宝

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16S+功能预测发Sciences：尸体降解过程

Nature：宏基因组关联分析(1) (2)

Nature子刊：肠道菌群如何划分肠型

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NBT-新年4篇35分文章聚焦宏基因组研究

一文读懂微生物组

一文讲透肿瘤微生物组研究怎么做

进化树 一文读懂

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Evolview基础 进阶

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众筹编写《微生物组数据分析与可视化实战》——成为宏基因组学百科全书的创始人(目录)

编者序：初衷、计划、要求、优势、目标和展望

111.Protein Cell：扩增子和宏基因组数据分析实用指南

112.CMJ：人类微生物组研究设计、样本采集和生物信息分析指南

121.个人电脑搭建微生物组分析平台(Win/Mac)

122.Linux系统和Shell命令行简介，走上数据分析之路

123.R简介和统计绘图

211.Alpha多样性箱线图(样章，11图2视频)

212.样本量和测序深度的Alpha多样性稀释曲线

213.维恩图和集合图(Venn&Upset)

221.Beta多样性PCoA和NMDS排序

222.Beta多样性限制性排序CPCoA/CCA/RDA/LDA

223.主成分分析PCA

231.菌群物种组成堆叠柱状图、弦图、词云

245.热图展示微生物组的物种和功能丰度或有无、距离矩阵

246.三元图的应用与绘图实战

251.全网最简单的网络图画法，小白福音包学包会

252.体现组间差异OTU模块的微生物网络图

341.基于高通量测序的微生物组研究技术简介

342.基于高通量技术的微生物组研究实验设计

343.微生物组研究写作的一般思路

西湖大学鞠峰组：环境宏病毒组学分析思路与常用工具

西湖大学鞠峰组：环境微生物的宏基因组学实例与新发现

Windows10安装Linux子系统Ubuntu 20.04LTS，轻松使用生信软件，效率秒杀虚拟机

宏基因组领域杂志简介及最新影响因子

75分钟入门微生物组数据分析和结果解读—刘永鑫(合肥，2021年6月23日)

青年生命科学论坛报告：扩增子和宏基因组数据分析与可视化流程—刘永鑫(北京210606)

宏基因组数据分析的机遇与挑战—刘永鑫(北京，2020年12月8日)

刘永鑫：20分钟讲解微生物组数据分析与可视化实战

南京袁军/文涛ISME：基于大数据整合准确预测土壤的枯萎病发生

北生院王金峰Gut：时序微生物组数据重现生物膜装配的动态过程 PPT+视频

西湖大学鞠峰：环境微生物宏基因组学(报告视频+PPT,11月23日)

2020年12月8日中科院刘永鑫报告：宏基因组数据分析的机遇与挑战

扩增子和宏基因组数据分析流程和可视化方案—刘永鑫(南京，2020年10月27日)

培训会议

1月6-8日，临床基因组/外显组数据分析实战技术研讨会

2月3-5日，微生物组-扩增子16S分析

2月17-20日，高级转录组分析和R语言数据可视化

3月24-26日，微生物组-宏基因组分析

4月8-10日，全国土壤环境生物安全与健康研讨会

5月20-22日，开幕式&全体大会精彩抢先看

5月19日,中国肠道大会宏基因组培训-刘永鑫/王军/戴磊连讲7小时

冠军出炉！2022『猛犸杯』国际组学数据创新大赛圆满收官

专刊征稿

Agronomy|3.9分JCR1区征稿/37天见刊-宏基因组解析农业微生物组专刊(刘永鑫/于鹏)

程旭/王蒙岑/袁梦婷/李建刚/熊武客座主编Frontiers根际微生物组专刊征稿(IF>6)

JoVE微生物组专刊征稿，写方法拍视频教程发SCI

人才招聘

深圳基因组所刘永鑫组招聘博士后4名(3年100万+文章奖励+项目绩效)

基因组所刘永鑫组招收客座研究生/海外联培博士(荷兰瓦大/澳州莫道克/比利时列日/爱尔兰都柏林)

基因组所食品科学中心贾耿介课题组诚聘博士后

生信人才，你的舞台——基因帮诚招英才！

南科大翟继先组招聘，博士生8万+，博后34万+

西奈山医学院房刚组招聘博后—宏基因组与表观基因组

林科院亚热带所袁志林组招聘博后—林木根际微生物

中山大学生科院骆观正教授课题组诚聘博士后及副研究员

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4 篇 NAR | 生物大数据时代，如何做好数据管理和再利用，发IF10+的数据库文章？

用ChatGPT 帮我写段生物信息代码

ChatGPT 给出的的代码不太完善，如何请他一步步改好？

代码看不懂？ChatGPT 帮你解释

ChatGPT也有犯晕的时候

发表16篇Nature、14篇Science！这位顶尖学者告诉你论文十法

PubMed插件：分区、影响因子和即时IF一目了然

我的博士之路（壮根美颜-康亚龙）：五年读博路，苦熬曙光明

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Science：“每周工作进展汇报”在博士培养中的作用

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谷歌学术上网和查文献、引用、作者和领域分析指南

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张启发院士的肺腑之言，值得每一位硕士/博士细细品读！

Nature子刊：你想成为生物信息学家？

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10篇一作SCI博士的走心分享—宏组学研究之“道”

985助理教授与二本教授哪个水平高？

清华生命院长王宏伟专访：面对这些情况，要勇于说“不”

从博后到PI的十个建议

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关于肠道菌群研究的7大事实和5大倡议

这篇文章说出了研究生和导师的相处真谛

研究生应锻炼的24种能力

要不要读博，以及读博后如何顺利毕业并找到理想工作？五个最接地气的忠告

Nature：给博士研究生的四条箴言Four golden lessons，颜宁推荐

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中国核酸数据库GSA数据提交指南 扩增子16S实例 宏基因组实例

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想发高分论文的同学看过来，这里有10分的杂志和主编可以了解一下！

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MetaboAnalyst 4.0，代谢组学研究利器的升级

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RepeatMasker：基因组重复序列注释

基因组注释 1重复序列 2非编码和编码基因 3功能注释Prokka

Canoco5绘制漂亮的DCA或CCA图

一个细菌基因组完整分析脚本

结构方程模型（SEM）的理论和基本实现过程

使用结构方程模型需要知道的那些事（理论篇）

高通量数据中批次效应的鉴定和处理

软件基础必学系列

Linux命令screen—终端切换，工作环境保存，画面同步，防断网

玩转花式截图、录屏——FastStoneCapture使用指南

Nature Method：Bioconda解决生物软件安装的烦恼

Conda软件安装：虚拟环境、软件通道、加速solving、跨服务器迁移

软件安装不上，可能是网速慢！Conda/R/pip/brew等国内镜像大全

数据的质量控制软件——fastQC

整合QC质控结果的利器——MultiQC

极速的FASTQ文件质控+过滤+校正fastp

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高颜值免费在线SCI绘图工具增加上传功能

国家微生物科学数据中心推出免费一站式生物信息分析云平台

在线差异基因分析 (支持自动和指定批次校正)

微生物组数据库: 一站式环境基因组学数据云平台更新啦！

1论文矢量图文字、线编辑

2论文图形编辑和排版

3排版后图形导出这样的Tiff/PNG

4显示网格移除剪切蒙版和背景

6直接选择工具删除白板

7魔棒工具批量操作

8几个快捷键

9图的放置和微调

10设置字体和微调

11调整对象大小

12批量变换同时选中的单个对象

13选中所有点

价值130欧元的《微生物组分析Microbiome Analysis》2018版电子书

价值1143元的《R语言统计分析微生物组数据》系列图书

再读《数量生态学：R语言应用》

微生物组领域近十年最重要的8个软件或算法

扩增子16S分析专题研讨论会——背景介绍

扩增子图表解读-理解文章思路

扩增子分析流程-把握分析细节

扩增子统计绘图-冲击高分文章

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PICRUSt2：OTU/ASV等16S序列随意预测宏基因组，参考数据库增大10倍 NBT文章解读 软件使用

CHM：FishTaco将样本功能同对应的微生物联系起来，得到功能改变的驱动因子

水稻微生物组时间序列分析 1模式图与PCoA  2a相关分析 2b散点图拟合 3冲击图 4随机森林回归

Nature Method：Rob Knight团队开发Striped UniFrac算法分析微生物组大数据

NBT：QIIME 2可重复、交互式的微生物组分析平台

1简介和安装Introduction&Install

2插件工作流程概述Workflow

3老司机上路指南Experienced

Genome Biology：人体各部位微生物组时间序列分析

4人体各部位微生物组分析Moving Pictures

5粪菌移植分析练习FMT

Microbiome：粪菌移植改善自闭症

6沙漠土壤分析Atacama soil

mSystems：干旱对土壤微生物组的影响

7帕金森小鼠教程Parkinson’s Mouse

Cell：肠道菌群促进帕金森发生ParkinsonDisease

8差异丰度分析gneiss

9数据导入Importing data

10数据导出Exporting data

11元数据Metadata

12数据筛选Filtering data

13训练特征分类器Training feature classifiers

14数据评估和质控Evaluating and controlling

15样品分类和回归q2-sample-classifier

16纵向和成对样本比较q2-longitudinal

17鉴定和过滤嵌合体序列q2-vsearch

18序列双端合并read-joining

19使用q2-vsearch聚类OTUs

20实用程序Utilities

21进化树推断q2-phylogeny

22命令行界面q2cli

23图形界面q2studio

24Python命令行模式Artifact API

25可用和开发中插件AvailableFuturePlugins

26开发新插件DevelopingPlugin

27语义类型Semantic

28社区Community

29参考数据库DataResources

30补充资源SupplementaryResources

31名词Glossary

32如何写方法和引用Citing

01-背景介绍

02-真菌引物选择

这个Venn 网络很漂亮！3分钟带你绘制！

NAR | 胡圣伟/倪伟/陈同-动物宏微生物组组成与功能综合数据库CRAMdb发布

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SILVAngs:16S/18S在线分析1  2

微生物组数据库（http://egcloud.cib.cn）正式上线

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扩增子分析神器VSEARCH 分析流程 2.8.1中文帮助文档

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LEfSe分析简介简化美化LEfSe分析结果图 LEFSe优化结果和配色版 视频教程

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MER： 基于ITS区域marker扩增真菌群落的准确性

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mSystems：鸟枪法宏基因组测序之外我们还能做什么

青岛能源所提出微生物组相似度新算法DMS

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宏基因组注释和可视化神器MEGAN入门

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5基于Kmer比较数据集sourmash

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他开发了基因界的百科全书，贡献却少有人知

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