R笔记:生存分析之竞争风险模型[概念与实操] |
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R 笔 记 :生存分析之 竞 争 风险 模型 [ 概念与 实 操 ] 转 自个人微信公众号【 Memo_Cleon 】的 统计 学 习 笔 记 : R 笔 记 :生存分析之 竞 争 风险 模型 [ 概 念与 实 操 ] 。 在《 生存分析之 Kaplan-Meier 曲 线绘 制与比 较 》文末,我 们 提到了 竞 争 风险 。由于出 现 了其他 结 局事件而阻碍或者改 变 了感 兴 趣的目 标结 局事件的 发 生(概率),相 对 目 标结 局事件而言, 这 里的其他 结 局事件就是 竞 争 风险 事件。 实际 上除了以全因死亡 为 研究 结 局,以死因、复 发 等 为 结 局的研究都广泛存在着 竞 争 风险 。比如以心血管死亡 为 研究 结 局,其他原因的死亡(如 车祸 意外、非心血管疾病死亡) 发 生 时 ,心血管死亡就不会再出 现 了,但如果将其他原因的死亡按 删 失( censoring ) 处 理,就意味着只要随 访时间 足 够长 , 这 些其他原因 导 致的死亡 对 象仍会再 发 生心血管疾病死亡, 这显 然与事 实 不符。同 样 以疾病复 发为结 局事件的研究中,研究 对 象的 死亡同 样导 致 该对 象不会再 发 生疾病的复 发 。也就是 说 当失效 时间 与 删 失 时间 不独立 时 。将 竞 争 风险 作 为删 失 处 理是不恰当的。 进 一步你可能会 问 , 删 失是不是目 标结 局事件的 竞 争事件 呢?当受 试 者失去随 访时 ( 发 生 删 失), 这 些受 试 者仍然有 发 生目 标结 局事件的 风险 ,只是研 究者无法 记录发 生的准确 时间 而已,而 竞 争 风险 的 发 生是阻碍了目 标结 局事件的 发 生(如死亡 发 生后,疾病不会再出 现 复 发 )。 换 句 话说 , 删 失只是阻止了你 观 察到目 标结 局事件,而 竞 争 事件 则 是阻止了目 标结 局事件的 发 生,所以 删 失并不是 竞 争事件, 竞 争事件的分析需要用一些 新的方法。 竞 争 风险 模型就是用于 这 种多 终 点的生存数据的分析。在 竞 争 风险 模型中,一个关 键 点是,一 个受 试 者只能 发 生一个 结 局事件 类 型, 这样该 事件的 发 生就排除了后 续 再 发 生其他事件 类 型。 本次笔 记 内容:( 1 ) 竞 争 风险 模型理 论 基 础 ;( 2 ) R 操作示例:累 积发 生率 单 因素比 较 ; ( 3 ) R 操作示例:特定原因 风险 回 归 ;( 4 ) R 操作示例:子分布 风险 回 归 / 累 积发 生率回 归 。 【 1 】 竞 争 风险 模型理 论 基 础 此部分有助于理解,不感 兴 趣的可只关注下面 这 几个主要 总结 性的 结论 : 不存在 竞 争 风险时 ,累 积发 生率函数与生存函数、 风险 函数、累 积风险 函数可以通 过简 单 的函数直接 转换 , 对 累 积发 生率的研究可以 转变 成 结 局事件生存函数、 风险 函数 / 累 积 风险 函数的分析, expβ 可以作 为 考察 协变 量 对 累 积发 生率的相 对 影响的度量。当存在 竞 争 风险时 ,累 积发 生率不 仅 取决于目 标结 局事件的 风险 函数,而且与 竞 争事件的 风险 函 数也有关系,此 时 累 积发 生率不能 简单 地 转变为对风险 函数和生存函数的研究; 特定原因 风险 集排除了 发 生 竞 争事件的 观 察人群,特定原因的 HR 可以反 应 暴露 对 目 标结 局事件的影响的关系,而 竞 争事件可以从 风险 集中移除 观 察人群来从 侧 面影响 这 种关 系。子分布 风险 集的构建包含了没 发 生任何事件的 观 察人群和那些已 经发 生 竞 争事件的 人群; 特定原因的 风险 比可以表示暴露的出 现 使得 结 局 发 生的 风险 是原来的 expβ 倍(或者比原 来增加 100(expβ-1)% ) ,但其 值 >1 并不意味着暴露 组 的累 积发 生率大于非暴露 组 ;子分 布 风险 比表示暴露的出 现 使得 结 局的累 积发 生率增加( HRsd>1 )或者减少 ( HRsdt) ,表示 时 刻 t 仍未 发 生 终 点事件(如死亡)的概率, 即 t 时 刻仍生存的概率。 t=0 时 , S(t)=1 ,随着 时间 的延 长 , S(t) 取 值 逐 渐 减小。生存函数是一个 累 积 函数,也称 为 生存累 积 分布函数或累 积 生存概率( cumulative survival probability ),也 简 称 为 生存率( survival rate )。从定 义 上来 说 概率 则 更符合 这 种累 积 函数的定 义 ;函数表达的是 一种关系,生存函数可以理解 为 随 时间变 化的生存 时间 概率;而率一般 说 明某种 现 象 发 生的 强 度,常与 时间 有关系,将累 积 生存概率翻 译为 生存率个人 觉 得不利于理解。 风险 函数( Hazard function ) h(t) :定 义为 f(t)/S(t) ,也称 为风险 率( hazard rate ),到 t 时 刻仍存 |
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