计算IC50常用的2种方法 |
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IC50(half maximal inhibitory concentration),即半抑制浓度,指某一种物质对某些生物程序抑制达到50%抑制效果时的浓度。对细胞增殖方面,可以理解为对细胞增殖的抑制效果达到细胞正常增殖水平50%时的药物浓度。通常用IC50来衡量药物对细胞的毒性或者细胞对药物的耐受能力,在药物实验中,常用IC50来评估实验中使用的药物浓度。IC50的计算方法很多,常用的有Excel、graphpad prism、SPSS等。 一、使用Excel计算IC50 首先将数据输入Excel中 抑制率 浓度 Lg(浓度) 21% 5 0.69897 32% 10 1 47% 20 1.30103 56% 30 1.47712125 67% 50 1.69897 因为药物浓度与抑制率的线性关系并不理想,因此需要用药物浓度的对数与抑制率作图。 药物浓度与抑制率作图,线性关系不好;
药物浓度的对数与抑制率作图,线性关系理想 根据线性公式计算抑制率为50%时的Y值,计算10为底,计算值为指数的冥,结果即为IC50。 二、使用graphpad prism计算IC50 打开软件后选择XY选项,Y值选择第一项: enter and plot a single y value for each poin, 点击create。 在X和Y栏中分别输入药物浓度和抑制率: 点击Analyze,在选项中选择:Transform concentration(X) 点击OK,在弹出的界面中选择Transform to logarithms。 再进入Analyze界面,点击OK,在弹出的界面中选择:Dose-response-Inhibition选项下的Log(inhibitor)vs.response—Variable slope(four parameters)。 结果如下,这一组数据的IC50为23.02
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