上传完成后，点击Proceed按钮进行下一步。

在接下来的众多分析项目中，我们仅选择Gene Regulatory Networks（GRN）中的TF-gene Interactions。

接着，选择TF-gene Interaction database，我们这里选择JASPAR数据库用于转录因子的预测。

很快，TF-gene的互作网络就完成了构建，如下，点击SIF，可下载sif格式的网络图文件导入到Cytoscape中进行分析和展示。

继续点击Proceed按钮，我们可以预览构建的TF-gene互作网络，默认的效果如下。

当然，我们也可以将网络图的背景调成白色、修改节点的颜色、布局等，如下图。

通过Download选项，我们可以指定下载文件的格式，除了下载PNG和SVG格式的图片；我们也可以下载GraphML、JSON两种格式的网络图，这两种格式也可以直接用Cytoscape打开和编辑。

接着，打开Cytoscape软件，通过File/Import/Network Fom File菜单导入本地网络文件，我这里导入的是上一步导出的GraphML文件。

导入本地网络后初始的效果如下：

在Style选项中Node（节点）属性设置窗口中，将节点的Shape改为椭圆；选中目标节点，通过Layout菜单下的Attribute Circle Layout/Selected Only命令，逐步将选中的节点排成环状网络，如下图。

选中10个Hub节点，将Fill Color自定义为其他颜色（点击第3个方块按钮），如这里的橙红色。

最终调整后的效果如下：

当然，你也可以将节点的大小（Size）与Degree建立映射，我这里不做演示，更详细的教程可参考《网络图分析工具Cytoscape快速上手》 一文。好啦，本次的分享就到这里啦！

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