miRNA微处理器pri-miRNA结构特征图

pri-miRNA：长度从几百到几千个碱基不等，带有5‘帽子和3’polyA尾巴，以及1到数个发夹径环结构。

pre-miRNA结构特征图

pre-miRNA：pri-miRNA在核酸酶Drosha和其辅助因子Pasha的作用下被处理成70个核苷酸组成的前体。

mature miRNA：pre-miRNA经进一步经过DICER酶剪切，形成长度约为22个碱基的单链成熟miRNA。

pri-miRNA>pre-miRNA>miRNA加工流程示意图

2.什么是miRNA种子区（“seed”region）?

5’端2-8个碱基被称为种子序列

miRNA种子区域靶标结合的示意图

3.miRNA与miRNA靶标结合类型有哪些?

miRNA与miRNA靶标结合主要有两类：5'-dominant Site和3'-compensatory Site

5'-dominant Site

5‘显性位点：满足经典种子区2-8完全互补结合的方式。

3'-compensatory Site

3’端补偿位点：5‘端并非满足2-8经典完全互补，知识部分互补，这样3‘端补偿位点结合，增强了miRNA与标靶结合稳定性。

4.miRNA命名与编号的方法和原则

1) miRNA(microRNA)成熟体命名规则(以动物miRNA为例)

①确定命名规则之前发现的miRNA(microRNA)，则保留原来名字，如hsa-let-7。

②miRNA(microRNA)成熟体简写成miR，再根据其物种名称，及被发现的先后顺序加上阿拉伯数字，如hsa-miR-122；

③高度同源的miRNA(microRNA)在数字后机上英文小写字母(a,b,c,…)，如hsa-miR-34a，hsa-miR-34b，hsa-miR-34c等；

④由不同染色体上的DNA序列转录加工而成的具有相同成熟体序列的miRNA(microRNA)，则在后面加上阿拉伯数字以示区分，如hsa-miR-199a-1和hsa-miR-199a-2；

⑤通常一个miRNA(microRNA)前体长度大约为70~80nt，很可能两个臂分别产生miRNA(microRNA)。

以前的做法是：

表达水平较高的miRNA(microRNA)后面不加任何符号，而表达水平较低的miRNA(microRNA)后面加上*号，如rno-miR-9*。有时带“*”的miRNA(microRNA)就根本不出现。

而如果没有明显的表达差异，则以“-5p”和“-3p”分别命名。如hsa-miR-26b-5p和hsa-miR-26b-3p，分别表明从hsa-mir-26b前体的5’端臂和3’端臂加工而来的。

在以前的命名中，有时也会以“-s”和“-as”来命名，但现在已经取消了这种命名方式。

注意：miRBase新版本对miRNA(microRNA)成熟体的名称进行了大量的修改，很多带“*”的miRNA(microRNA)都变成了“-5p”或“-3p”。当然，新名称下面对应有其原来的名称。

2) miRNA编号及名称(以动物miRNA为例)

miRBase记录了miRNA(microRNA)前体序列及miRNA成熟体序列，其中：

① miRNA(microRNA)前体

发夹状结构的miRNA(microRNA)前体转录本以“mir”命名，其编号以“MI”编号，如人的miRNA 122的前体ID为hsa-mir-122，Accession为MI0000442。

② miRNA(microRNA)成熟体

大约20～23nt的miRNA(microRNA)成熟体以“miR”命名，其编号以“MIMAT”编号，如人的miR-122有两个成熟体，其中之一ID为hsa-miR-122-5p ，Accession为 MIMAT0000421;另一个为ID为hsa-miR-122-3p ，Accession为 MIMAT000 4590。

3) 不同物种命名方式差别

①动物：

miRNA(microRNA)前体：以动物物种缩写+“-”+ mir+“-”+命名顺序，如hsa-mir-122；

miRNA(microRNA)成熟链：以动物物种缩写+“-”+ miR+“-”+命名顺序，如hsa-miR-122-5p；

②植物：

miRNA(microRNA)前体：以植物物种缩写+“-”+ MIR+命名顺序，如ath-MIR156a。注意：MIR是大写，并与命名顺序之间没有“-”；

miRNA(microRNA)成熟链：以植物物种缩写+“-”+ miR+命名顺序，如ath-miR156a。注意：miR是小写，并与命名顺序之间没有“-”；

③ 病毒：

miRNA(microRNA)前体：以病毒物种缩写+“-”+ mir+命名顺序，如bhv1-mir-B1；

miRNA(microRNA)成熟链：以病毒物种缩写+“-”+ miR+命名顺序，如bhv1-miR-B1。

5.miRNA预测方法

Diana-microT, TargetScanS和miRanda三种软件预测方法

预测没有绝对正确，按照软件评分为准。

6.miRNA作用机制中降解或抑制？

miRNA生物起源于作用机制图

miRNA降解mRNA：通过完全配对，降解mRNA抑制蛋白，qRT-PCR检测mRNA，WB检测蛋白都呈现明显的下调。

抑制mRNA翻译：通过部分配对，通过抑制翻译抑制蛋白，qRT-PCR检测mRNA没有变化，WB检测蛋白呈现明显下调。

作者：艾博思生物

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