DNA甲基化(5mC & 6mA)在复杂疾病中的调控机制研究

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DNA甲基化(5mC & 6mA)在复杂疾病中的调控机制研究

2024-07-12 01:06| 来源: 网络整理| 查看: 265

DNA甲基化是表观遗传领域中非常重要的一个研究方向,真核生物中最常见的DNA修饰是5mC(CG/CHG/CHH),而原核生物中6mA是最普遍的DNA修饰。然而,近几年来的报道发现DNA 6mA修饰在真核生物基因组中广泛存在。2018年7月和11月发表的文章都发现了人类基因组中丰富的6mA修饰。值得关注的是,这两篇人类基因组中6mA的功能研究却发现了两种不同的声音,其中Yan et al. 发现6mA水平在癌症中有明显下调,然而Jeremy N. Rich et al.却暗示了胶质瘤中甲基化水平是显著提升。因此,6mA在肿瘤甚至其他复杂疾病中的调控机制到底如何还需广大研究者们的深入研究~

 

当前全基因组范围的5mC研究技术主要是WGBS、RRBS、芯片、DNA甲基化免疫共沉淀MeDip技术,当前全基因组范围的6mA的主要研究技术是PacBio SMRT、MeDip-seq、miClip技术。划重点!Nanopore三代单分子纳米孔测序可以同时检测全基因组范围单碱基的5mC和6mA修饰位点,并给出单碱基的甲基化水平!

Nanopore测序技术借助单个分子通过纳米孔时引起孔两侧电位差来实现信号检测,纳米孔的直径仅允许单个核苷酸聚合物通过,而ATCG四种碱基以及带有甲基化修饰的碱基的带电性质不同,因此通过电信号差异特征即可检测出通过纳米孔的碱基类型,从而实现甲基化修饰的检测。 当然,DNA甲基化在医学中的研究方向也相当广泛。 1、肿瘤/疾病分型研究 该研究通过对一种罕见的侵袭性骨髓增殖性疾病进行DNA甲基化研究,通过差异甲基化位点的甲基化水平(高、中、低)将该疾病分为三个亚组。甲基化水平高的病人,预后较差;甲基化水平低的病人,预后良好。 RAS-pathway mutation patterns define epigenetic subclasses in juvenile myelomonocytic leukemia.(2017 Nature Communication) >查看文献查看文献查看文献查看文献


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