在开发Deeptools的同时，我们不断努力创建符合以下标准的软件：

有效地从BAM文件中提取读取内容 对它们进行各种计算

将对齐读取的BAM文件转换为bigwig文件 使用不同的规范化策略

利用 多处理器 （速度！）

生成 高度可定制的图像 （更改颜色、尺寸、标签、文件格式等）

使可能 customized down-stream analyses ，这意味着用户可以存储创建的每个数据集

模块化方法 -兼容性、灵活性、可扩展性（即我们可以添加越来越多的模块并使用现有的方法）

小技巧

如需支持或问题，请发送至 Biostars 。有关错误报告和功能请求，请打开问题 on github 。

请引证Deeptools2如下：

Ram_rez、Fidel、Devon P.Ryan、Bj_rn Gr_ning、Vivek Bhardwaj、Fabian Kilpert、Andreas S.Richter、Steffen Heyne、Friederike D_ndar和Thomas Manke。 "deepTools2: a next generation web server for deep-sequencing data analysis." Nucleic Acids Research (2016): gkw257.

此工具套件由 Bioinformatics Facility 在 Max Planck Institute for Immunobiology and Epigenetics, Freiburg 。

deepTools Galaxy _.

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