设为首页收藏本站
开启辅助访问

【图像分割】ITK

 您所在的位置：网站首页 › ct查看软件 › 【图像分割】ITK

【图像分割】ITK

2024-07-14 14:27| 来源: 网络整理| 查看: 265

ITK-SNAP分割标注教程

首先在左下角的搜索栏中输入ITK 在这里插入图片描述

单击应用即可打开软件 在这里插入图片描述 点击软件任务栏中的File-Open Main Image … 即可得到以下红色箭头所指的小界面 在这里插入图片描述

点击红色箭头处即可进入图像所在文件夹路径。如下红色箭头处所指。 在这里插入图片描述 双击需要勾画的类别文件夹 在这里插入图片描述

单击需要勾画的图像文件，最后点击打开即可 在这里插入图片描述

点击finish跳过 在这里插入图片描述

点击红色箭头处切换视窗 在这里插入图片描述

得到这个界面 在这里插入图片描述

可左键单击红色箭头处，将十字线移到左边，方便观看 在这里插入图片描述

左键单击红色箭头处，可跳转至导入标签界面 在这里插入图片描述 在这里插入图片描述

左键单击红色箭头处Actions. . . 在这里插入图片描述

选择Import Label Descriptions…，出现以下小界面 在这里插入图片描述

################################################ # ITK-SnAP Label Description File # File format: # IDX -R- -G- -B- -A-- VIS MSH LABEL # Fields: # IDX: Zero-based index # -R-: Red color component (0..255) # -G-: Green color component (0..255) # -B-: Blue color component (0..255) # -A-: Label transparency (0.00 .. 1.00) # VIS: Label visibility (0 or 1) # IDX: Label mesh visibility (0 or 1) # LABEL: Label description ################################################ 0 0 0 0 0 0 0 "Clear Label" 1 162 47 47 1 1 1 "leftVentricle" 2 0 255 0 1 1 1 "leftAtrium" 3 0 0 255 1 1 1 "rightVentricle" 4 255 255 0 1 1 1 "rightAtrium" 5 0 255 255 1 1 1 "inferiorVenaCava" 6 255 0 255 1 1 1 "LeftVentricularOutflowTractView" 7 255 239 213 1 1 1 "PulmonaryArtery" 8 110 110 217 1 1 1 "ShortAxisViewOuterRing" 9 217 160 105 1 1 1 "AorticValve" 10 171 16 145 1 1 1 "RightVentricularOutflowTractView"

点击Browse. . .选择标签文件并将点击打开

在这里插入图片描述 在这里插入图片描述

点击OK后出现以下小界面即可点击Close

在这里插入图片描述

以下正式开始勾画分割标注 点击图中1号红色框，在2号红色框中选择你所需要的标签，即可开始勾画 在这里插入图片描述 在红色箭头出按住右键，上下移动即可实现放大与缩小，便于勾画边界 在这里插入图片描述 在这里插入图片描述

按住左键拖动鼠标沿着边界勾画分割区域 在这里插入图片描述

按多几下（一般是两下，但有时需要多按几下，按到填充出来为止就好）回车键即可自动填充一下区域 在这里插入图片描述

对于画少了的区域可以放大勾画 在这里插入图片描述

对于画多了的区域可以先在红色框中选择Clear Label，再在红色箭头处将多余的区域画出来，按两下回车即可消除 在这里插入图片描述

不小心点歪的线可以通过按退格消除

在这里插入图片描述

出现以下弹窗说明没有体素更新，意思是你勾画的区域的标签与原标签相同，所以这时可以点击Close，然后检查红色框处的标签有没有选错 在这里插入图片描述 在这里插入图片描述

勾画完一张图后，滚轮往下画一下即可到下一张图像 在这里插入图片描述

点击1框后，可以在2框处看到当前所在的图像位置，如图显示，当前图像在整个视频的第150帧图像 在这里插入图片描述

最后所有图像勾画完后按Ctrl+S即可弹出保存界面，点击Finish即可 在这里插入图片描述

只勾画完部分图像，先行保存标注结果，再次勾画时导入标注的流程如下 打开ITK-SNAP软件，左键单击红色箭头出未勾画完的视频 在这里插入图片描述

左键单击红色框切换视图 在这里插入图片描述

点击任务栏中Segmentation，选择Open Segmentation … 选择保存的标注文件点击打开，并点击finish跳过，即可得到上次分割标注

在这里插入图片描述 在这里插入图片描述

再次勾画完后，按Ctrl+S即可保存新标注结果



【本文地址】


今日新闻

推荐新闻

CopyRight 2018-2019 办公设备维修网 版权所有 豫ICP备15022753号-3