人COL1A1和/或COL1A2基因的扩增、检测突变用引物及其试剂盒的制作方法

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人COL1A1和/或COL1A2基因的扩增、检测突变用引物及其试剂盒的制作方法

2023-12-26 18:22| 来源: 网络整理| 查看: 265

技术特征:

1.人col1a1基因的扩增用引物组,其特征在于,包括两对引物:扩增col1a1基因第1~25外显子与内含子的引物为核苷酸序列如seqidno.1所示的上游引物fp1和核苷酸序列如seqidno.2所示的下游引物rp1;

扩增col1a1基因第26~52外显子与内含子的引物为核苷酸序列如seqidno.3所示的上游引物fp2与核苷酸序列如seqidno.4所示的下游引物rp2。

2.检测人col1a1基因dna突变用引物组,其特征在于,包括如下15对检测col1a1基因第1~52外显子的引物;

用于外显子1的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.1所示的上游引物fp1和核苷酸序列如seqidno.5所示的下游引物rp3;

用于外显子2~5的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.6所示的上游引物fp4和核苷酸序列如seqidno.7所示的下游引物rp4;

用于外显子6~8的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.8的上游引物fp5和核苷酸序列如seqidno.9的下游引物rp5;

用于外显子9~11的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.10的上游引物fp6和核苷酸序列如seqidno.11的下游引物rp6;

用于外显子12~16的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.12的上游引物fp7和核苷酸序列如seqidno.13的下游引物rp7;

用于外显子17~20的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.14的上游引物fp8和核苷酸序列如seqidno.15的下游引物rp8;

用于外显子21~25的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.16的上游引物fp9和核苷酸序列如seqidno.17的下游引物rp9;

用于外显子26~29的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.18的上游引物fp10和核苷酸序列如seqidno.19的下游引物rp10;

用于外显子30~32的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.20的上游引物fp11和核苷酸序列如seqidno.21的下游引物rp11;

用于外显子33~36的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.22的上游引物fp12和核苷酸序列如seqidno.23的下游引物rp12;

用于外显子37~40的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.24的上游引物fp13和核苷酸序列如seqidno.25的下游引物rp13;

用于外显子41~44的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.26的上游引物fp14和核苷酸序列如seqidno.27的下游引物rp14;

用于外显子45~47的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.28的上游引物fp15和核苷酸序列如seqidno.29的下游引物rp15;

用于外显子48~50的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.30的上游引物fp16和核苷酸序列如seqidno.31的下游引物rp16;

用于外显子51~52的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.32的上游引物fp17和核苷酸序列如seqidno.33的下游引物rp17。

3.人col1a2基因的扩增用引物组,其特征在于,包括三对引物:

扩增col1a2基因第1~12外显子与内含子用引物为核苷酸序列如seqidno.34所示的上游引物fp18和核苷酸序列如seqidno.35所示的下游引物rp18;

扩增col1a2基因第13~34外显子与内含子用引物为核苷酸序列如seqidno.36所示的引物fp19和核苷酸序列如seqidno.37所示的下游引物rp19;

扩增col1a2基因第35~52外显子与内含子用引物为核苷酸序列如seqidno.38所示的上游引物fp20和核苷酸序列如seqidno.39所示的下游引物rp20。

4.检测col1a2基因dna突变用引物组,其特征在于,包括如下31对用于col1a2基因第1~52外显子与内含子的测序引物;

用于外显子1的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.34所示的上游引物fp18和核苷酸序列如seqidno.40所示的下游引物rp21;

用于外显子2的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.41的上游引物fp22和核苷酸序列如seqidno.42的下游引物rp22;

用于外显子3~4的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.43的上游引物fp23和核苷酸序列如seqidno.44的下游引物rp23;

用于外显子5的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.45的上游引物fp24和核苷酸序列如seqidno.46的下游引物rp24;

用于外显子6的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.47的上游引物fp25和核苷酸序列如seqidno.48的下游引物rp25;

用于外显子7~10的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.49的上游引物fp26和核苷酸序列如seqidno.50的下游引物rp26;

用于外显子11~12的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.51的上游引物fp27和核苷酸序列如seqidno.52的下游引物rp27;

用于外显子13~15的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.53的上游引物fp28和核苷酸序列如seqidno.54的下游引物rp28;

用于外显子16~17的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.55的上游引物fp29和核苷酸序列如seqidno.56的下游引物rp29;

用于外显子18~20的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.57的上游引物fp30和核苷酸序列如seqidno.58的下游引物rp30;

用于外显子21~23的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.59的上游引物fp31和核苷酸序列如seqidno.60的下游引物rp31;

用于外显子24~25的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.61的上游引物fp32和核苷酸序列如seqidno.62的下游引物rp32;

用于外显子26~27的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.63的上游引物fp33和核苷酸序列如seqidno.64的下游引物rp33;

用于外显子28~29的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.65的上游引物fp34和核苷酸序列如seqidno.66的下游引物rp34;

用于外显子30的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.67的上游引物fp35和核苷酸序列如seqidno.68的下游引物rp35;

用于外显子31的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.69的上游引物fp36和核苷酸序列如seqidno.70的下游引物rp36;

用于外显子32的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.71的上游引物fp37和核苷酸序列如seqidno.72的下游引物rp37;

用于外显子33的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.73的上游引物fp38和核苷酸序列如seqidno.74的下游引物rp38;

用于外显子34的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.75的上游引物fp39和核苷酸序列如seqidno.76的下游引物rp39;

用于外显子35~37的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.77的上游引物fp40和核苷酸序列如seqidno.78的下游引物rp40;

用于外显子38的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.79的上游引物fp41和核苷酸序列如seqidno.80的下游引物rp41;

用于外显子39的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.81的上游引物fp42和核苷酸序列如seqidno.82的下游引物rp42;

用于外显子40的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.83的上游引物fp43和核苷酸序列如seqidno.84的下游引物rp43;

用于外显子41的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.85的上游引物fp45和核苷酸序列如seqidno.86的下游引物rp44;

用于外显子42~44的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.87的上游引物fp45和核苷酸序列如seqidno.88的下游引物rp45;

用于外显子45~46的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.89的上游引物fp46和核苷酸序列如seqidno.90的下游引物rp46;

用于外显子47~48的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.91的上游引物f47和核苷酸序列如seqidno.92的下游引物rp47;

用于外显子49的pcr双向测序引物核苷酸序列为seqidno.93的上游引物fp48和核苷酸序列如seqidno.94的下游引物rp48;

用于外显子50的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.95的上游引物f49和核苷酸序列如seqidno.96的下游引物rp49;

用于外显子51的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.97的上游引物fp50和核苷酸序列如seqidno.98的下游引物rp50;

用于外显子52的pcr双向测序引物为核苷酸序列如seqidno.99的上游引物fp51和核苷酸序列如seqidno.100的下游引物rp51。

5.一种检测col1a1和col1a2基因突变位点的试剂盒,其特征在于,包括权利要求2所述引物组和权利要求4所述引物组。

6.根据权利要求5所述试剂盒,其特征在于,还包括dna测序试剂;所述dna测序试剂包括bigdye3.1混合液、edta溶液、无水乙醇、体积浓度75%乙醇水溶液和hi-di甲酰胺。

7.根据权利要求5或6所述试剂盒,其特征在于,还包括权利要求1所述引物组和权利要求3所述引物组。

8.根据权利要求7所述试剂盒,其特征在于,还包括pcr扩增试剂;所述pcr扩增试剂包括dntpmix、含mg2+的2×phantamaxbuffer和dna聚合酶。

9.根据权利要求8所述试剂盒,其特征在于,还包括pcr产物纯化试剂;所述pcr产物纯化试剂包括sap酶和exoi酶。

10.权利要求2所述引物组和权利要求4所述引物组在制备检测col1a1和col1a2基因突变位点的试剂中的应用。

技术总结本发明提供了人COL1A1和/或COL1A2基因的扩增、检测突变位点用引物及其试剂盒,属于基因检测技术领域。检测人COL1A1和/或COL1A2基因DNA突变的试剂盒,包括用于检测COL1A1与COL1A2基因第1至第52外显子突变的测序引物组。采用特异性引物组,针对COL1A1和COL1A2基因的第1~52外显子进行突变检测,确保了测定结果的准确性与特异性,针对COL1A1与COL1A2基因突变所导致的成骨不全I‑IV型、爱莱尔‑当洛综合征、卡菲氏病、成骨不全与爱莱尔‑当洛综合征合并症等遗传性疾病进行基因检测,可用于COL1A1与COL1A2基因基因突变相关联的复杂疾病的基因检测。

技术研发人员:鲁艳芹;韩金祥;张磊亮;王延宙;任秀智;彭传明;岳笑然受保护的技术使用者:山东第一医科大学(山东省医学科学院)技术研发日:2020.06.22技术公布日:2020.08.18



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