激酶抑制剂汇总|CDK2及其抑制剂

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激酶抑制剂汇总|CDK2及其抑制剂

2024-07-09 20:53| 来源: 网络整理| 查看: 265

前   言   

细胞分裂周期是生命中的一个基本过程,细胞中发生的一系列事件导致两个相同的子细胞的形成。C     DKs属于丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族,其激酶活性需要与细胞周期蛋白结合。据报道,     CDKs异常会导致增殖、基因组和染色体不稳定,从而导致人类癌症,并促进癌症的进展和侵袭性。    

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图1、细胞分裂周期,以及CDKs和检查点的作用

作者 | 橙子

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CDK2

与其他蛋白激酶类似,CDK2具有典型的双叶结构,N端(残基1-82)和C端结构域(残基83-297)。CDK2为ATP和磷酸化受体蛋白底物提供了相邻的结合位点,使得ATP的γ-磷酸面对底物表面Ser/Thr的羟基侧链。在无有丝分裂信号的情况下,CDK2处于不活跃状态。在G1期后期,CDK2活性的增加是因为:(1)e2f介导的CCNE基因转录,其蛋白产物结合并激活CDK2;(2)CDK4/6-cyclin D介导相互作用蛋白/激酶抑制蛋白(Cip/Kip)与CDK抑制剂p21Cip1、p27Kip1和p57Kip2CDK的分离,这些抑制剂与CDK2-cyclin复合物结合并使其失活;(3)CDK2磷酸化后Cip/Kip泛素化介导其蛋白水解。

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图3、人类激酶组中,FDA批准的71个激酶抑制剂

图2、CDK2的激活和抑制

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CDK2的功能

调控细胞周期与DNA复制——在细胞分裂过程中,CDK2是一个核心的细胞周期调节因子,从G1期晚期一直活跃到整个S期。CDK2通过结合cyclin E1或E2、cyclin A2、CAK复合物(CDK7、MAT1、cyclin H)磷酸化和CDC25A抑制磷酸化的去除而被激活。CDK2也磷酸化复制前复合物的几个组分,这是启动DNA合成所必需的。CDK2在协调细胞中心体复制周期中发挥重要作用。

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图3、NU6140是选择性调控细胞周期与DNA复制的CDK2抑制剂

调控DNA损伤反应(DDR)——在DNA损伤后,DDR在G1/S期阻滞细胞,以修复受损的DNA并在子细胞中保持基因组保真度。G1/S DNA损伤检查点的两种机制通过CDK2抑制增殖。以CDC25A为靶点进行降解,导致WEE1对CDK2的Thr14和Tyr15位点进行持续抑制磷酸化,从而阻断其进入S期。

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图4、CDK2在DNA损伤反应中的双重作用

调控细胞凋亡 ——CDK2调控凋亡通路的核心调控和功能成分。CDK2靶蛋白FOXO1在dsDNA断裂后触发DNA损伤诱导的凋亡中起着重要作用。CDK2还通过磷酸化促生存因子髓系白血病细胞分化蛋白(MCL-1)来防止细胞凋亡。

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图5、CDK2在调控细胞凋亡中的作用

03

CDK2活性的生物标志物

cyclin–CDK复合物的变化 :CDK2活性的主要调节因子是其结合的细胞周期蛋白: cyclin E1, cyclin E2, cyclin A1和cyclin A2 ,以及cyclin-CDK2复合物的细胞周期蛋白依赖的激酶抑制剂:p21, p27和p57。每一种cyclin和cyclin依赖的激酶抑制剂蛋白本身都受细胞周期的调控,控制这些蛋白表达的复杂调控网络在癌症中也是失调的。

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图6、cyclin–CDK复合物的变化在调控细胞周期中的作用

cyclin–CDK复合物的修饰:在细胞周期进程中,CDK2是一个增加生长因子信号传导的通道,是PI3K/AKT通路的靶点;AKT在S晚期和G2晚期磷酸化CDK2的Thr39位点,导致其进入G2/M期的细胞质易位。CDK2也被cyclin活化激酶(CAK)激活:CDK7、cyclin H和MAT1,即通过添加Thr160磷酸化和CDC25A磷酸酶而去除抑制性Tyr15磷酸化。

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图7、cyclin–CDK复合物的修饰在DNA损伤中的作用

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CDK2抑制剂

开发CDK2抑制剂的主要动机是它们作为抗癌药物的潜在应用,小分子CDK2选择性抑制剂将是解剖细胞过程或疾病基础的重要化学探针。1990s起,CDK2抑制剂的开发即已经有品种进入到临床阶段,但几乎都以多靶点抑制剂为主。

正构方向,CDK2中的Ilel0、Vall8、Ala31、Lys33、Phe80、Glu81、Phe8、Leu83、His84、Gln85、Asp86、Lys89、Glnl31、Leul34、Alal44和Aspl45等位点,在结合ATP的过程中发挥着至关重要的作用。但由于ATP结合口袋在CDK蛋白家族中的高度保守,使得针对ATP结合口袋开发选择性CDK2抑制剂较为困难,故非ATP结合的别构抑制剂也在开发当中,且已发现2个抑制剂新结合口袋:1)由Leu55、Lys56、Phe80、Asp145、Phe146和Lys33组成,位于ATP结合位点和C-端螺旋的中间;2)由Leu124、Phe152、Val154-156、Glu172、Gly176、Thr182、Val184、Val227-230、Ser232-234和Asp270-Asn272组成。

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图8、ATP和CDK2抑制剂的结合模式

Dinaciclib(III期)

开发公司为 默沙东 ,为 CDK1/2/5/9抑制剂 ,目前处在临床III期用于治疗难治愈的慢性淋巴细胞白血病。2011年,FDA授予Dinaciclib治疗CLL孤儿药资格。临床研究结果表明,Dinaciclib与利妥昔单抗联合用药治疗复发性慢性淋巴细胞性白血病时,患者的耐受性良好。

Seliciclib(II期)

开发公司为 Cyclacel Pharmaceuticals ,是 CYC-200系列口服小分子细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK1/2/5/7)抑制剂的 先导化合物,目前处于临床II期,用于治疗B淋巴细胞白血病,与吉西他滨/顺铂联合使用作为一线用药治疗非小细胞肺癌。另外,公司还在研究该药物用于潜在治疗与SARS-CoV-2感染(COVID-19)相关的炎症。

PF-07104091(I/II期)

开发公司为 辉瑞,是CDK2选择性抑制剂 ,口服用于多种癌症的治疗,包括乳腺癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、卵巢癌等。2020年9月,启动了晚期SCLC、晚期上皮性卵巢/输卵管/原发性腹膜癌、晚期乳腺癌和晚期NSCLC的I/II期试验;2020年10月,公司将该药物列为转移性乳腺癌的I期试验。2021年4月,临床前数据在第112届AACR年会上公布该药物可以用于治疗各种肿瘤模型。

Ebvaciclib(I/II期)

开发公司为 辉瑞,是CDK2/4/6抑制剂 ;2018年11月,在爱尔兰都柏林举行的第30届AACR年会上,首次公布了Ebvaciclib的体外和体内数据;Ebvaciclib对CDK2、4、5和6的结合亲和力较高,较脱靶的CDK1和CDK9高40倍。2018年3月,在接受过CDK4/6抑制剂治疗和HR阳性HER2阴性乳腺癌、转移性三阴性乳腺癌或晚期顺铂耐药性上皮性卵巢癌/输卵管癌的难治/复发患者中启动了I/II期试验。

Fadraciclib(I期)

开发公司为 Cyclacel Pharmaceuticals,一种CDK2/9抑制剂 ,静脉注射用于治疗晚期癌症,包括慢性淋巴细胞白血病、急性髓系白血病和骨髓增生异常综合征。2018年4月,临床前数据在芝加哥举行的第109届AACR年会上公布;2018年11月,启动复发或难治性CLL的临床I期试验;2019年7月,启动复发或难治性AML和MDS的临床I期试验。

NUV-422(I/II期)

开发公司为 Nuvation Bio,为CDK2/4/6抑制剂 ,临床开发用于胶质瘤的治疗。2020年11月,启动一项针对复发或难治性高级别胶质瘤成人患者的I/II期试验;2021年2月,该公司计划在启动脑转移I期试验,之后启动脑转移、雌激素受体阳性转移性乳腺癌的I期试验,再之后启动转移性去势耐药前列腺癌的I期试验。

结  语

在参与细胞分裂的所有必需蛋白质中,细胞周期蛋白依赖性激酶是最重要的一大类,且已完全证明其与癌症的发生相关。迄今为止,已上市的CDK抑制剂很少(仅有4个,且均为CDK4/6抑制剂),而其家族庞大且功能相对明确,故这个大家族中的药物开发潜力巨大。

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[1] 必应

[2] Cyclin-Dependent Kinase 2 Inhibitors in Cancer Therapy: An Update. J Med Chem, 2019. DOI: 10.1021/acs.jmedchem.8b01469.

[3] Targeting CDK2 in cancer: challenges and opportunities for therapy. Drug Discovery Today, 2019. DOI: 10.1016/j.drudis.2019.12.001.

[4] 细胞周期蛋白依赖性激酶2的功能及其抑制剂的研究. 中国细胞生物学学报/2021.

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