Windows 7

平台下

BLAST

本地化构建

冉昆

;

王少敏

【摘

要】

BLAST

是最常用的核酸和蛋白质同源性比较工具

,

对于基因组学和生物信

息学研究具有重要意义

.

以西洋梨基因组蛋白序列集为数据库文件

,

以巴梨水孔蛋白

(Aquaporin,AQP)

序列

(GenBank

登录号

BAB40142.1)

为查询序列

,

在

Windows 

7

平台下实现了

BLAST

本地化构建

,

为后续研究奠定了基础

.

【期刊名称】

《落叶果树》

【年

(

卷

),

期】

2015(047)003

【总页数】

4

页

(P39-42)

【关键词】

Windows7;

本地

BLAST;AQP;

西洋梨

【作

者】

冉昆

;

王少敏

【作者单位】

山东省果树研究所

,

山东泰安

271000;

山东省果树研究所

,

山东泰安

271000

【正文语种】

中

文

【中图分类】

TP311.56

BLAST

，全称

Basic Local Alignment Search Tool

，是“基于局部比对算法的搜

索工具”，由

Altschul

于

1990

年提出

[1]

。

BLAST

算法是一种基于局部序列比对

的序列比对算法，能够快速地找到核酸或蛋白序列之间的同源序列并对比对区域进

行打分以确定同源性的高低。

BLAST

提供了核酸和蛋白序列之间所有可能的比对