医学病理图片(SVS格式)的格式转换与显示

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医学病理图片(SVS格式)的格式转换与显示

2024-03-01 06:39| 来源: 网络整理| 查看: 265

最近在公司一直忙于做svs文件的处理工作,期间看了很多的博客还有国外的一些api文档,感觉稍微有了点了解,所以打算写下这篇博客记录这段时间的工作情况;

SVS文件是什么?

最开始拿到SVS文件一脸懵逼的,这货长这样(在windows下可以用Aperio ImageScope这个开源软件打开):

我现在接触的这种图片的大小一般在60M-1.5G之间,可以将图片放大到20倍左右,上面的这张图片来自于网站https://openslide.org/demo/,支持网页在线查看,有兴趣小伙伴可以去这个网站看看。当图片放大到最大分辨率时,可以看到组织里面的每一个细胞,可以说真的非常高清了。

SVS文件如何转存成通用格式(保持高分辨率)?这里以上面链接里面的 CMU-1-JP2K-33005.svs 文件为例,文件大小为:132.6M

我首先想到了opencv,因为图片处理这一块opencv比较方便。但是令我想不到的是,opencv竟然读取的时候就出错了“ cv2.error: OpenCV(3.4.2) /io/opencv/modules/imgcodecs/src/loadsave.cpp:74: error: (-215:Assertion failed) pixels



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