AutoDock是一套自动对接工具。它旨在预测小分子（例如底物或候选药物）如何与已知3D结构的受体结合。AutoDock 4实际上包含两个主要程序：autodock将配体对接至描述目标蛋白质的一组网格；自动网格会预先计算这些网格。除了将它们用于对接之外，原子亲和力网格也可以可视化。例如，这可以帮助指导有机合成化学家设计更好的粘合剂。 AutoDock Vina不需要选择原子类型并为其预先计算网格图。取而代之的是，它在内部为所需的原子类型计算网格，并且几乎立即执行此操作。 AutoDockTools，简称ADT，它除其他功能外，还可以帮助设置哪些键在配体中可旋转并分析对接。 AutoDock在以下方面具有应用程序： X射线晶体学；基于结构的药物设计；潜在客户优化；虚拟筛选（HTS）；组合库设计；蛋白质-蛋白质对接；化学机理研究。

安装AutoDOCK-4.2.6软件 详细步骤 （一）、AutoDOCK-4.2.6 支持版本号：4.2.6 及以上 源码包位置： /home/pct13/AutoDOCK/autodocksuite-4.2.6-x86_64Linux2.tar 已经安装好的版本链接位置： /home/pct13/AutoDOCK/x86_64Linux2 安装步骤： 涉及到的源码安装包： autodocksuite-4.2.6-x86_64Linux2.tar

1、编译安装AutoDOCK-4.2.6

2、成功判断条件

（二）AutoDOCKTools-1.5.6 支持版本号：1.5.6 源码包位置： /home/pct13/AutoDOCK/mgltools_x86_64Linux2_1.5.6.tar.gz 已经安装好的版本链接位置： /home/pct13/AutoDOCK/mgltools_x86_64Linux2_1.5.6 安装步骤：

成功判断条件：

详细步骤 （一）、执行pmv命令，打开软件 （二）、执行 点击File->Preferences->Set，在General面板中找到Startup Directory，将路径设置为/home/pct13/AutoDOCK/mgltools_x86_64Linux2_1.5.6/Data。点击File->Read Molecules，选择1crn.pdb文件打开