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2024-03-20 11:07| 来源: 网络整理| 查看: 265

近几年我国CMA的临床应用已逐步推广,为众多遗传病患者提供了精确的分子诊断。为此,我国也先后发布了《染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识》、《染色体基因组芯片在儿科遗传病的临床应用专家共识》。以更好的发挥CMA在临床检测的应用效果。目前大多数临床使用的CMA平台具有“靶向性”,可以 检测靶向区域的20~50kb的不平衡和与非靶向区域中100~250 kb的不平衡。

核型分析与aCGH比较

CMA主要包括微阵列比较基因组杂交技术(aCGH,array-based Comparative Genomic Hybridization)和微阵列单核苷酸多态性分析技术(aSNP, array Single Nucleotide Polymorphism)。通过aCGH技术能够很好地检出CNV,而aSNP除了能够检出CNV外,还能够检测出大多数的单亲二倍体(UPD)和三倍体,除此之外,由于SNP作为第三代遗传标记的自身特点,可以很好的应用在PGT-M的诊断中。

Abnormalities detected with conventional karyotype, CGH, and SNP arrays

核型分析、aCGH和aSNP的差异

CMA结果解读

2011 年美国医学遗传学会发布了CNV解释指南,建议采用 5 级报告系统,即致病性的、可能致病性的、不确定 的、可能良性的或良性的 CNV。CMA 报告应提供以下与报告的CNV 相关的特定信息:细胞遗传学位置 ( 染色体和条 带 );CNV 类别 ( 即缺失或重复 ) 及机制 ( 如果已知 );CNV大小与基因组构建的坐标 ( 即 hg19);5 级制度界定的重要声明 ( 包括证据和参考文献 );所涉及的基因 ( 如果CNV与已知综合征相关,则列出与病症相关的基因;其他情况下列出所有参 考序列基因 );适当的临床随访建议。

CMA的优势

1) 可以分析更广泛的标本类型,不需要组织培养 (CMA 同样适用于未培养的绒毛、羊水、胎儿组织和血液, 包括储存的样本和石蜡块 );

2) 分辨率更高,可以鉴定传统 染色体核型未发现的微缺失和微重复;

3) 检测平台可定制, 可以根据特定要求而在感兴趣的区域增加探针密度,调整 检测范围;

4) 更直观准确地描述核型上发现的结果,精准定位异常片段来源,客观数据的解释,而不是对带强度的主观视觉评估,对基因型 - 表型关系及预后给予更准确诊断,从而利于遗传咨询;

CMA的局限性

1) 不能有效测出基因组平 衡的染色体易位及倒位;

2) 低水平嵌合的检出依赖于平台 种类、样本类型、DNA 质量、数据质量以及不平衡的大小 等因素;

3) 可能无法阐明遗传失衡的染色体机制,缺乏关 于 CNV 机制的信息 ( 核型将在大多数情况下提供此信息, 如不平衡易位,标记染色体等 );

4) 可能无法检测或难以 检测到四倍体或其他多倍体;

5) 无法检测到平台上未覆盖 基因组区域的 CNV;

6) 受芯片设计所限,不可能检测出与 特定综合征相关的所有相关位点异常,阴性 CMA 结果不能 100%排除染色体疾病;

7) 并非所有的 CNV 都是致病性的, CMA 可能会检测到 VOUS(不明确的 拷贝数变异);

CMA适用检测对象

1)产前诊断检测有B超异常、发育迟缓的胎儿;

2) 胎儿父母一方或双方为平衡易位携带者;

3) NIPT筛查阳性患者胎儿检测;

4) 胚胎植入前诊断后怀孕胎儿的产前诊断;

5) 新生儿异常、儿童发育迟缓、智力障碍、多发畸形等查因;

6) 怀疑有拷贝数变异或LOH疾病检测;

7) 其他有检测需求病人;

现阶段人们对人类基因组的结构变异认识还并不完全,一些CNV的临床意义尚不明确,正常人群基因组中也存在着大量的拷贝数变异。因此,VOUS的检出会给CMA的咨询解释带来挑战。但随着更多大规模前瞻性队列研究和CMA 在产前诊断中的应用,CNV数据库将不断完善,更多染色体病基因型-表型关系将不断被阐明,CMA 在产前诊断领域将展现更大的应用价值。

参考文献

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