编译：微科盟蔚蓝，编辑：微科盟居居、江舜尧。

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导读   

人类肠道真菌群落被称为真菌微生物组(mycobiome)，在肠道生态系统和健康中发挥着重要作用。本研究旨在探讨中老年人肠道真菌组的决定因素和长期稳定性，并进一步探讨了肠道真菌和细菌与代谢健康的相互作用。本研究纳入了来自广州营养与健康研究队列的1244名参与者，表征了人类肠道真菌组的长期稳定性和决定因素，特别是长期的习惯性饮食消费。通过整合多组学分析研究了肠道细菌、真菌和粪便代谢组之间的生态联系。最后调查了肠道细菌和真菌之间的相互作用是否可以调节代谢风险。

结果表明，肠道真菌组成具有时间稳定性，主要由年龄、长期饮食习惯和宿主生理状态决定。具体而言，与中年个体相比，老年人中Blastobrys和Agaricomycetes spp减少，而Malassezia富集。乳制品消费量与Saccharomyces呈正相关，但与念珠菌呈负相关。值得注意的是，Saccharomycetales spp与肠道细菌多样性相互作用影响胰岛素抵抗。双向中介分析表明，细菌功能或粪便组氨酸可能介导毕赤酵母对血液胆固醇的影响。综上，本研究描述了中老年人肠道真菌组的社会人口学和膳食决定因素，并进一步揭示了肠道真菌组可能通过调节肠道细菌功能和代谢物与宿主代谢健康密切相关。  

论文ID

原名：Mapping the human gut mycobiome in middle-aged and elderly adults: multiomics insights and implications for host metabolic health

译名：绘制中老年人的肠道真菌微生物组：多组学见解和对宿主代谢健康的影响

期刊：Gut

IF：31.793

发表时间：2022.1

通讯作者：郑钜圣，陈裕明，Mark L Wahlqvist

通讯作者单位：西湖大学生命科学学院；中山大学公共卫生学院；澳大利亚莫纳什大学

DOI号：   10.1136/gutjnl-2021-326298  

实验设计

结果

1 人类肠道真菌组的组成和长期稳定性 

本文研究了作为GNHS队列一个子集的1244名平均年龄64.9岁的参与者。基于内部转录间隔区2(ITS2)序列确定了肠道真菌组的分类学特征。共检出204个肠道真菌属，其中最主要的类群为子囊菌Ascomycota、担子菌Basidiomycota和未分类真菌，平均相对丰度分别为77.0%、5.7%和17.0%(图1A–C)。经5%流行率过滤后，26个肠道真菌属被确定作为一组核心分类群，包括酵母属Saccharomyces、念珠菌属Candida、曲霉属Aspergillus、马拉色菌属Malassezia等(图1A和在线补充表S3)。通过文献回顾，我们发现这些肠道真菌属可能具有潜在的环境决定因素或来源(在线补充表S4)。我们发现GNHS队列中的子囊菌和担子菌丰度比与人类微生物组计划队列和丹麦队列中的相似(在线补充图S2B)。部分真菌属始终存在，在三个队列中检测到40个属(在线补充图 S2C和在线补充表 S5)。 

在对184名参与者进行为期约3.2年的随访后，利用ITS2真菌数据确定了肠道真菌组的长期稳定性(在线补充表S6)，数据显示子囊菌门的11个属(例如毕赤酵母属Pichia，链格孢属Alternaria和Wickerhamiella)随时间变化不显著(图1D和在线补充表 S7)，这表明这些属的相对丰度在时间上是稳定的。酵母菌、念珠菌属和曲霉属在基线时丰度较高，并且在后续随访过程中仍然是最普遍的分类群(在线补充图S3A、B)。超过40%的参与者中同一个体在两个时间点重复检测到7个核心真菌属(在线补充图S3C)。优势真菌门中这一概率超过85%。但8个属的相对丰度显著增加，例如青霉属Penicillium和念珠菌属，而26个属中有5个属丰度降低(配对Wilcoxon检验，q