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Published: September 20, 2020

生物多样性是生态学研究的基础，我们将在系统发育、功能性状、地理分布等方面详细探讨如何研究生物多样性。同时也会涉及许多生物信息学的内容，那么生物信息学非常有用，据说当前生物信息学的平均年薪已经接近10w刀，所以学习相关知识对于我们未来的发展非常重要。 Jesús N. Pinto-Ledezma and Jeannine Cavender-Bares

了解数据对于研究生物多样性非常重要，而现在使用的一个常见数据是描述谱系之间以及谱系之间的进化关系的系统发育树。从这里到本简短教程的结尾，我们将尝试解释如何导入/导出和处理系统发育信息的基础知识。

储存系统发育树的最常见格式是Newick，Nexus(Maddison et al. 1997)。 Newick格式将系统发育关系表示为”(“，”,“，”:“，具体如下： 括号将谱系链接到树的特定节点，而逗号“，”将从该节点下降的谱系分隔开。 节点名称后可以使用冒号标点“：”，后续数字值表示分支长度。 最后，用分号标点“;” 表示系统发育树的末端：