AIDD Pro 根据国内外各大网站以及人工智能药物设计主流新闻网站及公众号，从 AIDD会议、AIDD招聘，重大科研进展、行业动态、最新报告发布等角度，分析挖掘了每周人工智能辅助药物设计领域所发生的、对领域技术发展产生重大推动作用的事件，旨在帮助 AIDD领域研究人员和业内人士及时追踪最新科研动态、洞察前沿热点。如果您觉得符合以上要求的内容我们有遗漏或者更好建议，欢迎后台留言。

具体信息：

1.【图形神经网络】

现代药物研发极其昂贵和耗时。尽管计算方法有助于加速和降低药物发现的成本，但是现有的用于基于停靠的药物发现的计算软件包存在准确性低和等待时间长的问题。最近已经提出了一些基于机器学习的方法，通过提高评估蛋白质配体结合亲和力的能力来进行虚拟筛选，但是这些方法严重依赖于传统的对接软件来采样对接姿态，这导致了过度的执行延迟。在这里，我们提出并评估了一种新的基于图形神经网络(GNN)的框架MedusaGraph，它包括姿势预测(采样)和姿势选择(评分)模型。与之前以机器学习为中心的研究不同，MedusaGraph直接生成对接姿态，与最先进的方法相比，实现了10至100倍的加速，同时具有略好的对接精度。

链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.2c00127

DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jcim.2c00127

2.【量子化学】

邻苯二甲酸酐与选择的含氨基化合物缩合，得到结构修饰的异吲哚啉-1，3-二酮衍生物。标题化合物(230)已通过薄层色谱(TLC)、红外光谱、1H和13C核磁共振谱和质谱进行了表征。通过双重读出测定法评估所有化合物对H37Rv菌株的抗分枝杆菌活性。在合成的化合物中，化合物27具有18微米的显著IC50，使其成为该系列中最有效的化合物。与三氯生(1.32微米)相比，化合物27的InhA抑制(IC50)活性为8.65微米。计算研究如密度泛函理论(DFT)研究、分子对接和动态模拟研究说明了合成的化合物作为InhA抑制剂的反应性和稳定性。进行基于量子力学的DFT研究，以调查合成化合物中存在的分子和电子性质、反应性和成键性质，以及理论振动(IR)和各向同性值(1H和13C NMR)计算。

链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.2c01981

DOI：https://doi.org/10.1021/acsomega.2c01981

3.【分子动力学模拟】

RNA聚合酶II(POL II)与延伸因子形成复合体，进入转录过程的延伸阶段。在这项工作中，我们研究了延伸因子SPT5，并探索了SPT5的KOW1和KOW4结构域分别与核酸和−相互作用的蛋白质。我们使用三个常用的力场进行了分子动力学(MD)模拟，这三个力场是CHARMM c36m、Amber ff14sb和ff19sb。模拟表明，在所有力场下，蛋白质−与核酸的相互作用很强，静电结合自由能很低。与CHARMM相比，DNA在琥珀力场中具有相对稳定的构象。此外，我们使用CHARMM c36m和Amber ff19sb力场对完整的伸长复合体进行了MD模拟，以比较动力学和与孤立系统的相互作用。同样，在完整的伸长复合体模拟中观察到了KOW1和DNA的强烈相互作用，并且DNA被涉及POL II的SPT5−KOW1、SPT4和RPB2的相互作用网络进一步稳定。总体而言，我们的研究表明CHARMM和琥珀力场之间的差异强烈地影响着核酸的动力学。CHARMM提供高度灵活的DNA，而琥珀在很大程度上稳定了DNA结构。尽管整个相互作用网络的存在稳定了DNA，减少了两个力场结果的差异，但较小系统的力场差异可能反映了它们在生成准确的核酸动力学方面的问题。

链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.2c00121

DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jcim.2c00121

4.【蛋白质相互作用】

在这里，我们表明化学自由能计算可以定量计算蛋白质-蛋白质界面突变的影响。作为测试案例，我们使用了由小Rho-GTP酶CDC42及其下游效应子PAK1(一种丝氨酸/苏氨酸激酶)形成的蛋白质复合物。值得注意的是，CDC42/PAK1复合物提供了丰富的结构、诱变和结合亲和力数据，因为它在细胞信号传导和癌症进展中起着核心作用。在这种情况下，我们考虑了CDC42/PAK1复合物中的16个突变，并在结合亲和力的计算和实验数据之间获得了极好的一致性。重要的是，我们还表明，仔细分析突变氨基酸的侧链构象可以大大提高计算的估计值，解决与采样限制有关的问题。总的来说，这项研究表明化学自由能计算可以方便地整合到实验诱变研究的设计中。

链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.2c00348

DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jcim.2c00348

5.【酶抑制剂】

多靶点化合物的优化是药物发现周期中的一个多维难题。在这里，我们提出了一种系统的、多学科的方法来开发选择性抗寄生虫化合物。新的蝶啶衍生物的基于计算片段的设计以及晶体结构测定的迭代允许推导出多靶点抑制的结构−活性关系。该方法得到的化合物对布氏毛滴虫蝶啶还原酶1(PTR1)有明显的皮摩尔抑制作用，对主要毛滴虫PTR1有纳摩尔抑制作用，对寄生虫二氢叶酸还原酶(DHFR)有选择性的亚微摩尔抑制作用。此外，通过将多元药理学设计与基于属性的寄生虫优化相结合，我们发现了三个化合物，它们对布鲁氏毛滴虫具有微摩尔EC50值，同时保持了它们的靶抑制作用。我们的结果为进一步开发蝶啶类化合物提供了基础，我们期待我们的多目标方法普遍适用于抗感染药物的设计和优化。

链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.2c00232

DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.2c00232

6.【SARS-CoV-2】由严重急性呼吸综合征冠状病毒2(新型冠状病毒)引起的冠状病毒疾病疫情已感染全球超过5.2亿人，截至2022年5月，已有超过620万人感染。理解新型冠状病毒的细胞进入机制及其全部功能是开发改良疗法的重中之重。新型冠状病毒刺突糖蛋白(S蛋白)与宿主受体ACE2结合进行粘附，与丝氨酸蛋白酶furin和TMPRSS2结合进行蛋白水解激活并随后进入。最近的研究强调了弗林蛋白酶和S蛋白相互作用的分子细节。然而，TMPRSS2和S蛋白之间的结构和分子相互作用仍然是个谜。在这里，使用生物化学、结构、计算和分子动力学方法，我们研究了TMPRSS2如何识别和激活S蛋白以促进病毒进入。首先，我们在S蛋白的S2结构域中鉴定了三个潜在的TMPRSS2切割位点(S2’，T1和T2)，并报道了TMPRSS2的结构及其各自的催化三联体。通过使用计算建模和结构分析，我们模拟了TMPRSS2与S蛋白复合物的大分子结构，这激发了S蛋白加工或切割的机制，为病毒进入提供了新的途径。在结构导向药物筛选的基础上，我们还报道了潜在的TMPRSS2抑制剂及其在阻断TMPRSS2活性中的结构相互作用，这可能会阻碍与刺突蛋白的相互作用。这些发现揭示了TMPRSS2在激活新型冠状病毒进入和洞察可能的干预策略中的作用。

链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpclett.2c00967

DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.2c00967

7.【药物发现】

在药物发现的许多阶段，需要精确估计小分子的合成可及性。一些专家精心设计的评分方法和基于描述符的定量结构-活性关系(QSAR)模型已被开发用于合成可及性评估，但它们在药物发现中的实际应用仍然非常有限，因为预测准确性相对较低且模型可解释性较差。在这项研究中，我们提出了一个数据驱动的可解释预测框架，称为GASA(基于图形注意力的合成可达性评估)，通过区分化合物是容易合成还是难以合成来评估小分子的合成可达性。GASA是一种图形神经网络(GNN)架构，它通过应用注意机制来自动捕捉与综合可及性相关的最重要的结构特征，从而进行自我特征推断。假设分类边界周围的取样被用来提高GASA区分结构相似分子的能力。GASA被广泛评估并与两种基于描述符的机器学习方法(随机森林，RF；极端梯度推进(XGBoost)和四个现有的分数(SYBA:合成贝叶斯可及性；SCScore:综合复杂性得分；RAscore:逆合成可达性得分；SAscore:综合可及性得分)。我们的分析表明，与其他方法相比，GASA在区分相似分子方面取得了显著的性能，并且具有更广的适用范围。此外，我们展示了GASA如何通过给不同的原子分配注意力权重来学习影响分子合成可及性的重要特征。

链接网址：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.2c00038

DOI：https://doi.org/10.1021/acs.jcim.2c00038

各动态具体信息：

1.【武田】武田中国今日宣布，旗下创新药物重组抗血友病因子（猪序列）Obizur(Susoctocog alfa）上市许可申请（NDA）正式获得国家药品监督管理局药品审评中心受理，拟用于获得性血友病A（Acquired Hemophilia A，AHA）成人患者按需治疗和出血事件的控制。Obizur（Susoctocog alfa）是目前首个美国食品药品监督管理局（FDA）以及欧洲药品管理局（EMA），批准用于获得性血友病A的重组猪FⅧ（rpFⅧ）药物，有望为中国获得性血友病A患者提供新的治疗选择。

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2.【迈威】6月17日，迈威生物6MW3511注射液临床试验申请获国家药监局受理，拟用于多种晚期实体瘤的治疗。6MW3511是迈威生物利用人源化抗PD-L1的纳米抗体连接TGF-β RII突变体自主构建的双功能基团药物蛋白。该突变体设计有利于维持全分子的稳定性，降低天然TGF-β RII基团在生产过程和体内的降解。通过同时阻断PD-1/PD-L1和TGF-β/TGF-β-R双通路，以及简洁结构带来的优异的肿瘤局部穿透性，6MW3511有望进一步解决肿瘤微环境免疫抑制的难题。

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3.【Yseop】

2022年6月16日，世界领先的人工智能软件公司和自然语言处理先驱Yseop宣布，赛诺菲已选择与Yseop一起扩大其自然语言生成能力。赛诺菲将利用该平台加速其临床研究的提交过程，并将新疗法更快地带给患者。

此次合作是Yseop和赛诺菲于2017年建立的合作的扩大合作，两家公司总部均位于巴黎。合作实现了赛诺菲临床试验安全报告撰写流程的部分自动化。今年，赛诺菲公司计划继续将Yseop平台的使用范围扩大到更广泛的治疗和疫苗方面。

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4.【糖吉医疗】近日，杭州糖吉医疗科技有限公司（以下简称：糖吉医疗）宣布完成由深圳拓金创业投资基金和无锡国联新创联合投资的B轮融资，天超资本、车库咖啡在本次交易中担任财务顾问。本轮融资所得将用于完成糖吉医疗国家创新医疗器械“胃转流支架系统”的注册临床试验以及研发管线中多个新产品的研发与临床试验准备工作。

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5.【镁伽】2022年6月15日，镁伽科技宣布完成3亿美元C轮融资，由高盛资产管理、亚投资本、纪源资本联合领投，老股东创新工场持续超额加注，新加坡蘭亭投资（Pavilion Capital）、史带资本（Starr Capital）、雨盟资本、鸿为资本、园丰资本、泰合资本等跟投。同时，国内一家生物科技领域的龙头企业也参与本轮融资，成为继CXO行业巨头和自动化行业巨擘后又一个牵手镁伽的战略投资人，双方已就生物大分子领域的自动化业务展开广泛合作。此次募集资金将继续深化镁伽在生命科学智能自动化领域的研发投入及产能扩充，同时积极拓展业务及加速国际化进程。

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6.【EQRx】6月14日，EQRx, Inc宣布，英国药品和健康产品管理局 (MHRA)已受理第三代EGFR酪氨酸激酶抑制剂（TKI）阿美替尼的上市许可申请（MAA），用于治疗成人局部晚期或转移性非小细胞肺癌的一线治疗。该申请主要基于关键的Ⅲ 期 AENEAS 试验数据，这也是EQRx首次向监管机构提交上市申请。

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7.【礼来】

6月13日，FDA宣布批准礼来/Incyte合作开发的Olumiant（巴瑞替尼）新适应症，用于治疗成人重度斑秃。这是FDA批准的首个斑秃系统疗法（全身疗法）。

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8.【默沙东】6月13日，默沙东宣布美国FDA已受理Keytruda用于IB期(≥4厘米）、II期或IIIA期非小细胞肺癌（NSCLC）患者完全手术切除肿瘤后的辅助治疗。该申请主要基于关键III期KEYNOTE-091试验（也称为EORTC-1416-LCG/ETOP-8-15–PEARLS）的数据。PDUFA日期为2023年1月29日。如果获批，Keytruda将是FDA批准的首个不考虑PD-L1表达水平的早期NSCLC辅助免疫疗法。

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9.【礼来】6月13日，D. E. Shaw Research (DESRES)公司宣布，已与礼来就Kv1.3靶向治疗药物达成全球独家许可协议。根据协议条款，礼来获得Kv1.3靶向治疗药物（包括DES-7114）在全球的临床开发和商业化权利，并向DESRES支付6000万美元的首付款、4.75亿美元里程金和销售版税。

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各会议具体详情和参会方式：

主办方：图与推荐

会议时间：2022年6月25日

会议地点：线上

会议主旨：设置GNN 基础模型、复杂图、NLP与图、大规模图平台、推荐与图、基于图的可解释性、风控与图、自然科学与图等8大论坛，将从多个视角，带你彻底了解图机器学习！

会议入场券：免费注册报名

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会议时间：2022年6月30日-7月1日

会议地点：浙江·杭州

会议主旨：主题内容涵盖细胞与基因治疗、抗体药、核酸药物研发进展及趋势以及细胞与基因治疗研发工艺、复杂制剂开发和改良、新药投融资及产业发展等方面内容；同时聚焦全球医药行业热点事件，开展深入探讨与技术交流，加强国内外产业界的交流与合作。通过前沿的技术介绍，专业大咖观点碰撞，优秀经验分享，创新思维交流，给与会的专家、学者带来一场知识盛宴，为全球生物医药产业的发展贡献力量。

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主办方：迪易咨询 Deliver Life Sciences

会议时间：2022年7月7-8日

会议地点：中国上海

会议主旨：随着全球范围内学术, 医疗, 资本与产业的积极参与, ATMP相关在研产品数量呈现爆发式增长，同时该领域也面临着法规监管, 工艺开发, 商业化生产等诸多问题与挑战。为促进来源于中国的高质量研发创新, 快速推进先进治疗产品的研发与商业化进程，由迪易咨询 Deliver Life Sciences 主办的“第四届先进治疗产品创新峰会 - 细胞与基因治疗研发及创新论坛2022 ”。

会议入场券：药企及科研单位: RMB 2,600/位（2022年4月30日前: 2,200/位）；标准注册: RMB 3,200/位（2022年4月30日前: 2,800/位）

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主办方：贝尔福-蒙贝利亚技术大学

会议时间：2022年7月11-12日

会议地点：线上线下同时举行，地点为在Belfort, France at UTBM – Campus of Sevenans

会议主旨：展示人工智能技术在能源应用方面的最新成果，为同行们提供交流研讨的机会。

会议入场券：免费注册

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主办方：药相知&药相荟

会议时间：2022年7月14-15日

会议地点：杭州海外海皇冠大酒店

会议入场券：998元/人

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主办方：商图

会议时间：2022年7月14-15日

会议地点：上海

会议主旨：从创新抗体药物（新靶点/ADC/双多抗/…）和小分子创新药物（PROTAC/AI/变更/…）两大维度出发，特邀150余位创新药研发领军企业、科研学者、法规监管专家与科学家深入新药“源头”进行分享，以临床价值为目标，探索“大小分子”多线发展策略。

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主办方：博腾生物，佰傲谷Biovalley，BioBAY

会议时间：2022年8月19-20日

会议地点：苏州中茵皇冠假日酒店

会议主旨：本次会议将持续聚焦中国细胞基因免疫治疗学术前沿进展，涵盖更多新兴药物领域，深度挖掘和分享最新的研究成果。增设临床话题，邀请临床相关同仁分享临床试验成果，探讨最新的临床情况。

会议入场券：限时免费注册

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主办方：万怡医学

会议时间：2022年10月13-14日

会议地点：上海扬子江丽笙精选酒店

会议主旨：大会以“技术革新引领小分子药物新浪潮”为主题，特邀60+领袖讲者，800+行业专家聚焦最前沿的技术和行业资讯，以主旨报告、圆桌讨论、VIP欢迎晚宴、一对一商务对接等多种形式，打造全方位产学研资讯交流合作平台。

会议入场券：588元/人

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各公司介绍，投递方式：

望石智慧（StoneWise），成立于2018年，是一家致力于用人工智能驱动新药研发的科技公司。结合人工智能、计算化学、计算生物学、量子化学和药物化学等多学科，打造世界领先的新型药物研发平台，提升新药研发中的效率和成功率。

具体信息及简历投递请戳我

西湖欧米创立于2020年7月，坐落于浙江省杭州市西湖区云栖小镇西湖大学国家科技园区，是一家专注于生物技术攻关与辅助临床诊断的创新型公司。针对与生命健康有关的核心问题，西湖欧米致力于以技术创新为驱动力、以多模态大数据为基础，使用AI赋能微量临床组织的高通量蛋白质组分析等组学技术辅助精准医学和药物研发。

简历投递：登录BOSS直聘搜西湖欧米进行投递

水木未来（北京）科技有限公司于2017年成立于北京清华园，是一家专注于临床前新药研发加速服务的平台型公司。公司依托清华大学自主研发的革命性结构解析方法学与AI技术，拥有顶级的生命科学专家技术团队，致力于为全球制药公司和生命科技公司提供新药靶点验证，化合物库筛选，先导化合物发现，以及治疗性抗体研发等综合性技术服务。

简历投递：登录BOSS直聘搜水木未来进行投递

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