miRNA命名规范 |
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①确定命名规则之前发现的miRNA(microRNA),则保留原来名字,如hsa-let-7。 ②miRNA(microRNA)成熟体简写成miR,再根据其物种名称,及被发现的先后顺序加上阿拉伯数字,如hsa-miR-122; ③高度同源的miRNA(microRNA)在数字后机上英文小写字母(a,b,c,…),如hsa-miR-34a,hsa-miR-34b,hsa-miR-34c等; ④由不同染色体上的DNA序列转录加工而成的具有相同成熟体序列的miRNA(microRNA),则在后面加上阿拉伯数字以示区分,如hsa-miR-199a-1和hsa-miR-199a-2; ⑤通常一个miRNA(microRNA)前体长度大约为70~80nt,很可能两个臂分别产生miRNA(microRNA)。 以前的做法是:表达水平较高的miRNA(microRNA)后面不加任何符号,而表达水平较低的miRNA(microRNA)后面加上*号,如rno-miR-9*。有时带“*”的miRNA(microRNA)就根本不出现。 而如果没有明显的表达差异,则以“-5p”和“-3p”分别命名。如hsa-miR-26b-5p和hsa-miR-26b-3p,分别表明从hsa-mir-26b前体的5’端臂和3’端臂加工而来的。 在以前的命名中,有时也会以“-s”和“-as”来命名,但现在已经取消了这种命名方式。 注意:miRBase 18.0对miRNA(microRNA)成熟体的名称进行了大量的修改,很多带“*”的miRNA(microRNA)都变成了“-5p”或“-3p”。当然,新名称下面对应有其原来的名称。 案例请见:http://www.mirbase.org/cgi-bin/mirna_entry.pl?acc=MI0000442 |
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