· 产品定义

4D-蛋白质组学是基于timsTOF Pro质谱仪，通过捕集离子淌度（TIMS）与同步累积连续碎裂（PASEF）扫描模式进行差异定量蛋白质组学研究。该技术核心是在传统3D分离（保留时间、质荷比、离子强度）基础上，增加肽段的碰撞截面积（CCS），实现第4维度（离子淌度）的分离检测。 4D-DIA蛋白质组学是基于timsTOF Pro离子淌度平台的DIA技术，通过数据非依赖采集-同步累积连续碎裂（diaPASEF）扫描模式进行差异定量蛋白质组学分析。将DIA技术与基于timsTOF Pro上的diaPASEF技术相结合，具有高扫描速度和高灵敏度优势的同时，外加第四维离子淌度分离，使DIA数据在采集时不牺牲窗口循环速度的同时，降低谱图复杂度和提高离子利用率，实现了蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。

· 技术路线

· 技术优势

1. 4D技术加持，更加适合微量样本；

2. 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制，灵活方便；

3. 采用布鲁克的timsTOF Pro质谱平台，检测速度提升近一倍。

· 数据分析

标准数据分析内容

鉴定分析

鉴定与定量结果统计；单个样本蛋白质鉴定结果统计；韦恩图

表达差异分析

差异结果统计；差异结果柱状图；火山图；聚类分析图；

多组的比较分析（组别>=3）

mufzz聚类；雷达图；箱线图

功能分析

亚细胞定位；结构域分析；GO功能分析；KEGG通路分析；互作网络分析

质量控制分析

肽段离子质量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白质丰度比分布

高级数据分析

功能分析

GSEA富集分析

临床药物研究

药物靶点注释

标志物筛选

集成机器学习

与临床表征的联合分析

热图；弦图；ROC分析；WGCNA分析

关于个性化数据分析需求，请来电咨询

部分数据分析结果展示

· 推荐组合产品

大分子专属平台，质量与效率双重保障：4D-DIA + 4D-DIA磷酸化蛋白质组

· 推荐应用领域

1. 药物应答、基因敲除/过表达的蛋白表达谱分析

2. 植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究

3. 疾病生物标志物与药物作用靶点高通量分析

4. 蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选

5. 各种物种的蛋白质组草图构建

· 送样建议(特殊样本可直接咨询021-5466-5263/400-066-6761) 

样品类型

推荐样本量

（新建Library）

推荐样本量

（不建Library）

动物组织类

常规动物组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等）

30mg-2g

15-2mg

植物组织类

柔软组织（木本植物的叶、花等，草本科植物，藻类，蕨类植物，大型真菌等）

100mg-2g

50mg-2g

微生物类

菌类

50mg-2g

20mg-2g

细胞样品

悬浮/贴壁培养细胞

1-10× 10^7

0.5-10× 10^7

体液样本

血清/血浆

0.1ml-0.2ml

0.05ml-0.2ml

外泌体

血浆（未提取外泌体）

4ml

2ml

提取完成的外泌体

50μg

20μg

其他类

细胞上清

5ml-10ml

2ml-5ml

· 参考文献

1. Immune suppression in the early stage of COVID-19 disease. Nat Commun. 2020.

4D-DIA-人尿液-新冠病毒早期感染机制

2. diaPASEF: parallel accumulation–serial fragmentation combined with data-independent acquisition. Nat Methods. 2020.

4D-DIA技术原理介绍：diaPASEF