3D slicer简易版中文教程🙃 |
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界面简单介绍✌️
首先是版本问题,这里使用的版本是 ,slicer版本不同的话是使用也会有不同,所以为了安全食用这份不完全指南,请确保我们使用的是一样的版本 总体功能如上所示,不完全指南里主要介绍的内容包括蓝色绿色和红色,黄色部分功能太多,还没怎么研究过。 数据导入【红色部分】红色部分主要包括,DATA,DICM和SAVE: DATA:暂时是用这个来加载已经标注好的segement文件的,slicer保存segments是保存为一个SEGMENTS文件夹,打开之后里面会有3-5个文件。加载segments的话,点击红色区域的DATA,然后选择这个2020-11-05-Scene.mrml即可。 【常见问题1:加载segments后无法只观看一个segment】 这通常是因为加载data的时候将SEGMENTS文件夹下多个文件加载进入,这时候进入到黄色区域里的DICM功能,会发现有多个segmentation文件,取消多余的的segmentation文件的眼睛,或者右键删除就可以了。 ps:多个文件的眼睛控制在这里 【注:Segmentation preview.seg.nrrd和Segmentation.seg.nrrd都只保留了segmentations的数据集合!你也可以先打开病人的dicm再加载它的nrrd文件】 DICM:加载DICM文件的,easy,注意是选择整个文件夹,这个一般是第一次导入进来的时候用,之后这些DICM就不用再导入了 SAVE:你懂的,就是保存的意思,放在你想放的地方就可以了 常见功能【蓝色部分】按顺序挨个介绍一下 第一个就是Data界面,来看我们使用的现在这个文件的数据情况,可以控制小眼睛之类的。 第二三四五还不会用,毕竟是个不完全指南(不是☠️ 最后一个是重头戏【标注功能】,这个具体使用在后面说,这里就先不讲 展示功能【绿色部分】这里基本上三个功能比较常用 第一个是我们使用的展示界面的样式,一般我会选择右边三个ct左边3D,或者上面3D下面三个CT的模式 白色小箭头就是移动的拉拽的功能,介绍一下基本的操作快捷键,方便搬砖(并不 CT界面的操作 缩放:ctrl +滚轮 移动:shift+鼠标左键 按住后拖动 3D界面的操作 缩放:滚轮 移动视角:鼠标左键按住 平面移动:shift+鼠标左键 按住图像中的内容拖动 平面旋转:ctrl+左键 通常操作: 撤销:ctrl+z 恢复:ctrl+y 所有快捷键: 第三个彩色窗口是调节窗宽窗位的,点击然后左键按住,左右拉和上下拉就可以调节ct画面了,NICE~👏🏻 【附送一个调节窗宽床位的小妙招】可以按住ctrl然后再按住鼠标左键,会出来一个矩形框,然后把想要关注的内容框在矩形框内就会很好的显示我们想要看的内容了!芜湖,直接起飞🧑🏻🚀 单独的快捷操作介绍(好翻找) CT界面的操作缩放:ctrl +滚轮 移动:shift+鼠标左键 按住后拖动 3D界面的操作缩放:滚轮 移动视角:鼠标左键按住 平面移动:shift+鼠标左键 按住图像中的内容拖动 平面旋转:ctrl+左键 通常操作撤销:ctrl+z 恢复:ctrl+y 所有快捷键: Segment Editor操作不完全介绍✍🏻介绍仍然按照区块不同来划分,具体情况如下 基本操作【红色部分】最基本的增加、删除、3D展示功能,使用都是字面意思的程度,唯一需要注意的就是Show 3D默认不打开,所以添加蒙版后,记得打开,不然看不到3D效果!眼睛功能和ps一样,就是看不看得到,右边的标志还不太懂具体有啥用,暂时没有影响到使用。 具体操作【黄色部分】这一块比较重要,功能很多,但是现在会用的还不多,所以这里只能介绍一小部分功能,【所以这就是为什么叫不完全指南的原因么? Paint:画笔功能,常见的图画操作,不过这个画起来手感并不是很好,因为它得一直涂抹 Draw:勾选出一块位置,不会加到3D显示里 Erase:橡皮擦,字面意思 接下来的三个都不会用 Threshold:阈值调节,这个是比较重要的一个功能,它可以根据阈值的选择自动描画图像中符合阈值范围的地方,使用方法如下 在图像中右键点击,画出一个小圆,他会计算圆圈内的阈值范围,尽量把想要勾选的地方(比如这根髂总血管)勾选完毕,然后再手调整一下阈值,尽量让别的组织少被标到,调节满意之后点击Apply即可! Margin:边缘,这个主要是调节重建之后得到的图像的粗细,因为treshold重建出来的可能并不会把所有需要的内容都勾上了,比如我们在重建骨头的时候,就需要调节margin来把没有选上的骨头增厚,也可以缩小,不过这个尺度不太好把控 接下来又是两个不会用(假装用不着 Scissor:人称小剪刀,我的最爱😗,配合Masking使用,简直不能再快乐了(masking的使用在下面马上就说!) operation:操作和字面意思是一样哒,擦除选择范围内,擦除选择范围外,填充内,填充外 shape:模式依次是自由选择,圆形,矩形 slice out:裁剪类型依次是 无限(整个空间),positive(此帧往上的空间),negative(此帧往下的空间),symmetric(此帧),这个不需要硬记positive和negative试两下就知道啦 Island:岛,对那个孤立的点的操作,因为自动生成会有很多孤立的细碎点,所以可以用岛功能来去掉部分孤立无用的坨坨,使用如字面意思 Logical operators:逻辑操作,就是我们常用的复制、添加、删减、取并集,取反,清除之类的操作,善用可以减少工作量 选择操作【蓝色部分】这个部分还挺有用的,就是它的逻辑有点怪,使用不太像是字面理解的意思 Editable area:可操作区域,这个就是选择哪个范围是可以操作的,注意,它是限制了你画的区域,具体画在哪个蒙版,自己要看清楚 intensity range:就是控制你可以画的点的亮的强度, modify other segments:这个是用来分割的神器,一般情况下请选择 overwrite visible,之类的visible不是最上面眼睛是否打开的visible,是你现在选择的蒙版的意思。注意不要宣城overwrite all了,选了这个的话其他蒙版也会跟着改。最后一个allow overlap的话可以有选择性的复制,举个栗子🌰,这个工具可以和其他的工具配合使用,比如只在固定范围内修改之类的! 这是一根血管,我们想要把黄色框框内的血管单独分割一块出来 选择我们新加的空白蒙版,剪刀配置如下 用剪刀够选出我们想要的血管位置,完成! |
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